116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1680 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 
710 aa  1453    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1740  C-5 cytosine-specific DNA methylase  91.41 
 
 
669 aa  1291    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.313379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1917  C-5 cytosine-specific DNA methylase  48.93 
 
 
535 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.92455  normal  0.374422 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0980  C-5 cytosine-specific DNA methylase  48.26 
 
 
488 aa  433  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.407551  hitchhiker  0.0000325424 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1691  C-5 cytosine-specific DNA methylase  40.67 
 
 
697 aa  432  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1961  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.96 
 
 
516 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0550818  normal  0.0497342 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2642  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.71 
 
 
555 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000523714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2843  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.22 
 
 
710 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0878273 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1040  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.54 
 
 
659 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2003  C-5 cytosine-specific DNA methylase  41.94 
 
 
516 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00321659  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3506  C-5 cytosine-specific DNA methylase  41.73 
 
 
516 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.39459  hitchhiker  0.00149895 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3006  prophage LambdaSo, type II DNA modification methyltransferase, putative  42.13 
 
 
557 aa  350  4e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3029  DNA cytosine methyltransferase family protein  37.45 
 
 
609 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0585199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2828  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.27 
 
 
684 aa  344  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.645339 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3654  C-5 cytosine-specific DNA methylase  41.21 
 
 
494 aa  324  4e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620081  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3461  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.95 
 
 
619 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000315602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3427  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  34.45 
 
 
594 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000565023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3699  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.17 
 
 
579 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2449  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.88 
 
 
646 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199486  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2731  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.84 
 
 
668 aa  171  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5090  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.96 
 
 
618 aa  145  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4214  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.18 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000361487  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  30.63 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  30.96 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5574  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.34 
 
 
496 aa  74.7  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  29.17 
 
 
434 aa  72  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.22 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0568  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.47 
 
 
553 aa  70.9  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0234117  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  34.8 
 
 
443 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3037  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.86 
 
 
483 aa  69.7  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0129697  normal  0.245214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  31.6 
 
 
671 aa  67.4  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.92 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 
418 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 
418 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4922  C-5 cytosine-specific DNA methylase  22.37 
 
 
652 aa  64.3  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  27.92 
 
 
415 aa  64.3  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.13 
 
 
357 aa  63.5  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  26.24 
 
 
375 aa  63.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4678  DNA-cytosine methyltransferase  24.73 
 
 
345 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.201023  normal  0.324334 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  28.78 
 
 
652 aa  62.4  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  27.72 
 
 
421 aa  61.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  29.08 
 
 
373 aa  61.2  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0012  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.73 
 
 
333 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684081  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 
389 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2386  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.22 
 
 
295 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0340074  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.33 
 
 
405 aa  58.9  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.64 
 
 
362 aa  59.3  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  26.9 
 
 
438 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.28 
 
 
415 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  25.77 
 
 
365 aa  58.2  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  27.45 
 
 
371 aa  57.4  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3461  C-5 cytosine-specific DNA methylase  22.08 
 
 
687 aa  57  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4845  hypothetical protein  28.44 
 
 
505 aa  56.6  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.033259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6268  C-5 cytosine-specific DNA methylase  39.02 
 
 
552 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  27.54 
 
 
431 aa  57  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  28.09 
 
 
354 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  32.21 
 
 
446 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  25.38 
 
 
404 aa  54.3  0.000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  23.86 
 
 
406 aa  53.9  0.000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  28.25 
 
 
467 aa  53.5  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  25.89 
 
 
320 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4776  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.23 
 
 
615 aa  53.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.034234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  27.5 
 
 
395 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  28.02 
 
 
500 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.71 
 
 
657 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  26.06 
 
 
313 aa  52.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  26.6 
 
 
440 aa  52  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  26.6 
 
 
440 aa  52  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  23.01 
 
 
390 aa  52  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  25.84 
 
 
418 aa  52  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  29.95 
 
 
318 aa  51.6  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  24.26 
 
 
362 aa  51.6  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
373 aa  51.2  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  31.3 
 
 
429 aa  50.8  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  28.9 
 
 
406 aa  50.8  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  27.46 
 
 
437 aa  50.4  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.05 
 
 
435 aa  50.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  24.77 
 
 
358 aa  50.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
358 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  30.25 
 
 
305 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  27.68 
 
 
320 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3845  DNA-cytosine methyltransferase  25.45 
 
 
371 aa  49.3  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.305468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  24.88 
 
 
460 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  24.88 
 
 
460 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  23.61 
 
 
423 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 
454 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  25.81 
 
 
319 aa  48.5  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  24.38 
 
 
329 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  22.66 
 
 
308 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  25.7 
 
 
335 aa  47.8  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  24.73 
 
 
423 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.64 
 
 
424 aa  47.8  0.0007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 
465 aa  47.8  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4216  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.72 
 
 
329 aa  47.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.757892  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  25.37 
 
 
335 aa  47  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  25.79 
 
 
438 aa  47  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  27.33 
 
 
355 aa  47.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  25.87 
 
 
313 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  30.26 
 
 
352 aa  45.8  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>