36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6268 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6268  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 552 aa  1131    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0568  C-5 cytosine-specific DNA methylase  41.34 
 
 		 553 aa  355  7.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0234117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5574  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.97 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3037  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.7 
 
 		 483 aa  227  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0129697  normal  0.245214 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4922  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.46 
 
 		 652 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4776  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.89 
 
 		 615 aa  144  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.034234 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3461  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.57 
 
 		 687 aa  124  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1917  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.65 
 
 		 535 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.92455  normal  0.374422 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0980  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.16 
 
 		 488 aa  95.1  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.407551  hitchhiker  0.0000325424 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1961  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.6 
 
 		 516 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0550818  normal  0.0497342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2449  C-5 cytosine-specific DNA methylase  22.96 
 
 		 646 aa  91.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2003  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.6 
 
 		 516 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00321659  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3506  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.43 
 
 		 516 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.39459  hitchhiker  0.00149895 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3654  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.43 
 
 		 494 aa  87.4  5e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4058  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.86 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3006  prophage LambdaSo, type II DNA modification methyltransferase, putative  24.84 
 
 		 557 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2731  C-5 cytosine-specific DNA methylase  22.78 
 
 		 668 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3699  C-5 cytosine-specific DNA methylase  22.82 
 
 		 579 aa  67.4  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1691  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.88 
 
 		 697 aa  63.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1740  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.4 
 
 		 669 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313379 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1360  type II restriction-modification system DNA cytosine-specific methylase  39.73 
 
 		 78 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000045922  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1040  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.24 
 
 		 659 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3427  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  24.51 
 
 		 594 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000565023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2642  C-5 cytosine-specific DNA methylase  23.04 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523714 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4214  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.49 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000361487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  39.02 
 
 		 710 aa  57  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5090  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.33 
 
 		 618 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3461  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.81 
 
 		 619 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000315602 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2828  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.25 
 
 		 684 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.645339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2843  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.14 
 
 		 710 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0878273 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  32.5 
 
 		 487 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2386  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  38.75 
 
 		 295 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0340074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1539  DNA-cytosine methyltransferase  35.87 
 
 		 569 aa  48.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  23.81 
 
 		 375 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  33.72 
 
 		 438 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2924  DNA-cytosine methyltransferase  31.03 
 
 		 537 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>