263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4214 on replicon NC_008765
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008765  Ajs_4214  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 
304 aa  616  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000361487  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2386  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  56.9 
 
 
295 aa  331  9e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0340074  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0012  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.69 
 
 
333 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684081  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1917  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.09 
 
 
535 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.92455  normal  0.374422 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  25.16 
 
 
338 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3037  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.83 
 
 
483 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0129697  normal  0.245214 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3654  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35 
 
 
494 aa  99.8  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620081  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
324 aa  99.4  7e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.6 
 
 
328 aa  96.3  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  27.51 
 
 
329 aa  94.7  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  28.16 
 
 
313 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0980  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.77 
 
 
488 aa  92.8  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.407551  hitchhiker  0.0000325424 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2449  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.26 
 
 
646 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199486  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5574  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35 
 
 
496 aa  90.5  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1040  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.33 
 
 
659 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3699  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.37 
 
 
579 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2731  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.71 
 
 
668 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0568  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.32 
 
 
553 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0234117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  34.29 
 
 
438 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  29.34 
 
 
365 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  24.1 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5090  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.37 
 
 
618 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  25.16 
 
 
308 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 
425 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  24.65 
 
 
413 aa  85.9  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.18 
 
 
710 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1740  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.18 
 
 
669 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.313379 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  25.08 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  25.94 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  24.13 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  24.53 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  27.08 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  26.54 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4922  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.28 
 
 
652 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  33.71 
 
 
652 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  29.26 
 
 
389 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  30.12 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  30.12 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.66 
 
 
357 aa  78.6  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 
374 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  27.55 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  23.27 
 
 
727 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3461  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.19 
 
 
687 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  22.71 
 
 
331 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  21.69 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  29.34 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  32.58 
 
 
671 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2924  DNA-cytosine methyltransferase  24.93 
 
 
537 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  24.43 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  27.08 
 
 
436 aa  73.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3006  prophage LambdaSo, type II DNA modification methyltransferase, putative  26.95 
 
 
557 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1360  type II restriction-modification system DNA cytosine-specific methylase  45.83 
 
 
78 aa  72.4  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000045922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  27.57 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  30.64 
 
 
487 aa  71.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  30.65 
 
 
417 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  32.02 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  22.22 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1961  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.5 
 
 
516 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0550818  normal  0.0497342 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.87 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2003  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.5 
 
 
516 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00321659  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  28.28 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.12 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3506  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.5 
 
 
516 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.39459  hitchhiker  0.00149895 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  30.15 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  27.5 
 
 
424 aa  69.3  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  26.65 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  25.75 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1691  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.23 
 
 
697 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  23.92 
 
 
409 aa  68.2  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.66 
 
 
323 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  27.1 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  24.76 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  31.71 
 
 
334 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  31.35 
 
 
657 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  25.45 
 
 
437 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  23.59 
 
 
468 aa  67  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  27.05 
 
 
344 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  32.7 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  23.51 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4776  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.38 
 
 
615 aa  66.6  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.034234 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 
508 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  25.15 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  28.32 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3525  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.71 
 
 
571 aa  65.9  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000124097  hitchhiker  0.00602561 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  22.9 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  25.15 
 
 
414 aa  65.9  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  23.38 
 
 
325 aa  65.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.81 
 
 
451 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  31.55 
 
 
418 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  31.55 
 
 
418 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  28.95 
 
 
398 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0676  DNA-cytosine methyltransferase  28.11 
 
 
434 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  24.92 
 
 
309 aa  65.5  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  30.06 
 
 
424 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.26 
 
 
435 aa  63.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  28.23 
 
 
500 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  30.54 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>