More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4652 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
413 aa  855    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  30.5 
 
 
338 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.98 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  45.4 
 
 
319 aa  152  1e-35  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  45.4 
 
 
416 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
329 aa  149  9e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  29.29 
 
 
331 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.75 
 
 
328 aa  143  6e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  29.89 
 
 
324 aa  141  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  45.45 
 
 
305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  29.21 
 
 
419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  40.88 
 
 
416 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  39.08 
 
 
308 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  42.33 
 
 
727 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  39.44 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  40.12 
 
 
320 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  44.94 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  40 
 
 
467 aa  133  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  27.62 
 
 
406 aa  133  6e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  31.28 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  29.65 
 
 
425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  40.98 
 
 
417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  27.82 
 
 
428 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  38.07 
 
 
313 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  28.3 
 
 
426 aa  130  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  42.26 
 
 
320 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.08 
 
 
418 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  34.96 
 
 
310 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  37.57 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  37.42 
 
 
313 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  27.02 
 
 
407 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  37.5 
 
 
323 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  30.23 
 
 
487 aa  127  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  31.28 
 
 
417 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  40.48 
 
 
415 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  29.43 
 
 
424 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.43 
 
 
451 aa  124  4e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  41.57 
 
 
437 aa  123  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  38.73 
 
 
336 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.4 
 
 
357 aa  122  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  38.41 
 
 
350 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  26.44 
 
 
436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.37 
 
 
323 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  40.12 
 
 
483 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  37.58 
 
 
334 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  37.82 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  37.2 
 
 
350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  39.33 
 
 
657 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  26.33 
 
 
423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.57 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  35.93 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  38.65 
 
 
490 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  26.28 
 
 
423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  40.96 
 
 
318 aa  115  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  37.16 
 
 
373 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  36.63 
 
 
460 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  36.63 
 
 
460 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  35.57 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  26.91 
 
 
404 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  26.62 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  27.49 
 
 
491 aa  110  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  26.26 
 
 
368 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  35.85 
 
 
335 aa  107  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  26.17 
 
 
474 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  33.71 
 
 
315 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  34.27 
 
 
348 aa  103  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  34.48 
 
 
456 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  34.48 
 
 
456 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  30.05 
 
 
345 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  29.35 
 
 
444 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  33.74 
 
 
379 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
472 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  33.33 
 
 
476 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  33.33 
 
 
476 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  32.82 
 
 
447 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  33.33 
 
 
472 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  33.33 
 
 
472 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  27.34 
 
 
471 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  33.33 
 
 
472 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  33.33 
 
 
472 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  33.33 
 
 
476 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  33.95 
 
 
328 aa  101  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  33.33 
 
 
476 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  33.33 
 
 
472 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1588  DNA-cytosine methyltransferase  25.52 
 
 
385 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  33.33 
 
 
476 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  32.45 
 
 
350 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  32.82 
 
 
472 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  37.1 
 
 
239 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  35.44 
 
 
427 aa  99.8  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  24.4 
 
 
373 aa  98.6  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  25.31 
 
 
421 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  27.73 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  33.7 
 
 
386 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  26.2 
 
 
415 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  29.25 
 
 
372 aa  97.4  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0452  DNA-cytosine methyltransferase  25.31 
 
 
392 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  hitchhiker  0.00155723 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  23.94 
 
 
370 aa  97.1  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04441  DNA-cytosine methyltransferase  26.6 
 
 
689 aa  96.3  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.355889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>