285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1728 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 483 aa  996    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  37.88 
 
 		 437 aa  278  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  51.35 
 
 		 239 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  39.27 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  36.77 
 
 		 372 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  35.74 
 
 		 324 aa  156  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0057  phage-related DNA methylase, C-terminal region  63.06 
 
 		 114 aa  150  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  35.74 
 
 		 327 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  34.22 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  33.59 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  40.85 
 
 		 727 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  41.57 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  38.95 
 
 		 490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  43.79 
 
 		 460 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  43.79 
 
 		 460 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  43.35 
 
 		 427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  39.63 
 
 		 331 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  43.56 
 
 		 305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  60.55 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  42.26 
 
 		 328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  41.18 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  43.79 
 
 		 456 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  43.79 
 
 		 456 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  39.88 
 
 		 320 aa  123  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  42.01 
 
 		 315 aa  123  9e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  42.35 
 
 		 319 aa  121  3e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  40.23 
 
 		 417 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  40.12 
 
 		 413 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  39.01 
 
 		 389 aa  118  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.93 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  39.88 
 
 		 425 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  39.64 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  36.07 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  39.05 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  37.36 
 
 		 426 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  40.36 
 
 		 311 aa  113  8.000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  38.46 
 
 		 417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  35.43 
 
 		 657 aa  111  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  35.15 
 
 		 308 aa  111  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  37.04 
 
 		 313 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  37.36 
 
 		 419 aa  110  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  34.72 
 
 		 417 aa  110  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  37.99 
 
 		 424 aa  110  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  37.14 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  32.16 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  35.91 
 
 		 416 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  34.76 
 
 		 436 aa  108  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  38.55 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  38.55 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  34.68 
 
 		 373 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  33.04 
 
 		 428 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  31.65 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  32.78 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  35.47 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  34.48 
 
 		 320 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  37.36 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  33.33 
 
 		 313 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  35.58 
 
 		 334 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  38.46 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  29.68 
 
 		 336 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  34.91 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  36.78 
 
 		 323 aa  100  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  32.74 
 
 		 467 aa  99.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  39.02 
 
 		 329 aa  99.8  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  28.38 
 
 		 406 aa  99  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1499  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 		 703 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  30.94 
 
 		 380 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  34.71 
 
 		 335 aa  97.8  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  34.36 
 
 		 328 aa  96.7  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.17 
 
 		 283 aa  96.7  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  32.22 
 
 		 310 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2841  DNA-cytosine methyltransferase  30.39 
 
 		 719 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.57 
 
 		 418 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  36.26 
 
 		 390 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  36.04 
 
 		 423 aa  95.9  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  33.52 
 
 		 345 aa  94.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  35.23 
 
 		 313 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0393  DNA-cytosine methyltransferase  27.5 
 
 		 719 aa  94  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  30.84 
 
 		 471 aa  94  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  35.94 
 
 		 404 aa  93.6  7e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.5 
 
 		 424 aa  93.6  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  32.49 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  32.49 
 
 		 423 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  30.15 
 
 		 472 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1470  DNA-cytosine methyltransferase  34.92 
 
 		 411 aa  90.9  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1389  DNA-cytosine methyltransferase  33.93 
 
 		 387 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  30.15 
 
 		 472 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  30.15 
 
 		 472 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  29.65 
 
 		 476 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  29.65 
 
 		 476 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  30.15 
 
 		 472 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  30.15 
 
 		 472 aa  90.5  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  30.15 
 
 		 472 aa  90.5  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  29.65 
 
 		 476 aa  90.5  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  29.65 
 
 		 476 aa  90.5  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  29.65 
 
 		 476 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  30.15 
 
 		 472 aa  90.1  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0566  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 		 449 aa  89.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.76321  normal  0.105811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  32.18 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  40.29 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>