189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1470 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1470  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
411 aa  848    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1337  DNA-cytosine methyltransferase  47.88 
 
 
393 aa  375  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.911958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1389  DNA-cytosine methyltransferase  47.53 
 
 
387 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376971  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4109  DNA-cytosine methyltransferase  47.88 
 
 
395 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560504  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1810  C-5 cytosine-specific DNA methylase  47.61 
 
 
382 aa  360  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2261  DNA-cytosine methyltransferase  45.55 
 
 
387 aa  336  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4756  DNA-cytosine methyltransferase  44.85 
 
 
375 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0547  DNA-cytosine methyltransferase  45.26 
 
 
383 aa  301  2e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0452  DNA-cytosine methyltransferase  30.85 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  hitchhiker  0.00155723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1588  DNA-cytosine methyltransferase  30.13 
 
 
385 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4240  DNA-cytosine methyltransferase  31.05 
 
 
387 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481849  normal  0.893444 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  26.53 
 
 
417 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  25.76 
 
 
428 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  25.93 
 
 
415 aa  97.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  24.93 
 
 
313 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  22.92 
 
 
338 aa  93.2  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  33.85 
 
 
416 aa  92.8  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  35.11 
 
 
483 aa  91.3  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  27.41 
 
 
424 aa  90.9  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  32.64 
 
 
417 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  23.11 
 
 
438 aa  89  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  24.32 
 
 
727 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  24 
 
 
331 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  26.56 
 
 
491 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  23.46 
 
 
413 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  32.09 
 
 
419 aa  86.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  25.78 
 
 
474 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  32.4 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  33.33 
 
 
472 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  32.39 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  25.2 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  33.33 
 
 
472 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  33.33 
 
 
472 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  33.33 
 
 
472 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  33.33 
 
 
472 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  33.33 
 
 
472 aa  82.8  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.74 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  30.81 
 
 
426 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  33.64 
 
 
476 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  33.64 
 
 
476 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  33.64 
 
 
476 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  33.64 
 
 
476 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  33.64 
 
 
476 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  33.8 
 
 
471 aa  80.9  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  23.67 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  32.07 
 
 
657 aa  80.5  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  31.28 
 
 
436 aa  80.1  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  22.14 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  40.8 
 
 
490 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  23.94 
 
 
350 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  22.6 
 
 
318 aa  79.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  23.31 
 
 
313 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.69 
 
 
451 aa  79  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  30 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  28.14 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  23.08 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.6 
 
 
328 aa  77  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  35.47 
 
 
383 aa  76.3  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  30.17 
 
 
487 aa  75.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  23.94 
 
 
319 aa  75.5  0.000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  37.3 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  22.34 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  31.37 
 
 
417 aa  74.7  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  35.95 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  31.46 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  31.46 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 
416 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  20.34 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  28.23 
 
 
345 aa  72.8  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  30.81 
 
 
239 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  24.78 
 
 
456 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  24.42 
 
 
495 aa  72.4  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  30.29 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  24.67 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  23.1 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  32 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  31.89 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  24.44 
 
 
456 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  37.39 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  31.89 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  22.28 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  23.02 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  24.06 
 
 
417 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
460 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
460 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  35.65 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  25.45 
 
 
358 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  35.88 
 
 
380 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  22.28 
 
 
421 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  30.05 
 
 
447 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl304  deoxycytosine methylase  32.77 
 
 
455 aa  63.2  0.000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.2985e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  23.06 
 
 
418 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  23.06 
 
 
418 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  29.73 
 
 
310 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  29.38 
 
 
437 aa  62.8  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  23.93 
 
 
350 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
423 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.02 
 
 
435 aa  61.6  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>