219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4756 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4756  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
375 aa  750    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1810  C-5 cytosine-specific DNA methylase  54.86 
 
 
382 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1337  DNA-cytosine methyltransferase  51.96 
 
 
393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.911958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2261  DNA-cytosine methyltransferase  50.81 
 
 
387 aa  352  5.9999999999999994e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4109  DNA-cytosine methyltransferase  49.86 
 
 
395 aa  348  8e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560504  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1389  DNA-cytosine methyltransferase  49.05 
 
 
387 aa  333  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376971  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0547  DNA-cytosine methyltransferase  51.57 
 
 
383 aa  323  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1470  DNA-cytosine methyltransferase  44.85 
 
 
411 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0452  DNA-cytosine methyltransferase  38.01 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  hitchhiker  0.00155723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1588  DNA-cytosine methyltransferase  38.13 
 
 
385 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4240  DNA-cytosine methyltransferase  38.86 
 
 
387 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481849  normal  0.893444 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  25.94 
 
 
417 aa  116  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  26.18 
 
 
419 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  24.79 
 
 
338 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  26.18 
 
 
329 aa  103  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  26.45 
 
 
416 aa  101  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  27.85 
 
 
436 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  28.04 
 
 
417 aa  99.4  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  26.26 
 
 
424 aa  98.2  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  24.93 
 
 
305 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  23.67 
 
 
416 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  24.51 
 
 
327 aa  92.8  9e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  22.35 
 
 
324 aa  89  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  21.63 
 
 
311 aa  89.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  26.06 
 
 
415 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  46.72 
 
 
490 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  29.71 
 
 
727 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  24.37 
 
 
329 aa  87  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 
438 aa  85.9  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  34.91 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  30.17 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  29.08 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  23.2 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  27.92 
 
 
320 aa  84  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  35.03 
 
 
313 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  23.2 
 
 
350 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  33.91 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  25.45 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  29.14 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  29.73 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  22.49 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  24.71 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  33.88 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  45.13 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.74 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  34.64 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  34.87 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  27.72 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  26.61 
 
 
487 aa  80.1  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  31.18 
 
 
437 aa  79  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  29.21 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  32.95 
 
 
239 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  30.04 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  26.04 
 
 
472 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  26.36 
 
 
472 aa  77.4  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  31.71 
 
 
352 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  23.36 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  25.78 
 
 
472 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  26.36 
 
 
472 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  26.36 
 
 
472 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  26.36 
 
 
472 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  34.22 
 
 
323 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  32.39 
 
 
323 aa  75.5  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30.39 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  24.6 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.39 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  31.28 
 
 
425 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  25.33 
 
 
447 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  29.88 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  29.69 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  27.32 
 
 
476 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  27.39 
 
 
476 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  27.39 
 
 
476 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  27.39 
 
 
476 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  27.32 
 
 
476 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  28.48 
 
 
328 aa  72.4  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  30.69 
 
 
657 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  25.84 
 
 
472 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.24 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  29.84 
 
 
495 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  27.58 
 
 
471 aa  70.5  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  22.55 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.63 
 
 
418 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  31.09 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  27.71 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  32.67 
 
 
508 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  30.9 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  33.5 
 
 
386 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  32.64 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  29.32 
 
 
379 aa  67.8  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.57 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  31.37 
 
 
454 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  29.56 
 
 
342 aa  67  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  32.12 
 
 
390 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  23.77 
 
 
415 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  28.82 
 
 
467 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  29.71 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  32.53 
 
 
385 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>