284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47357 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  100 
 
 
495 aa  1021    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  31.55 
 
 
417 aa  163  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  35.02 
 
 
416 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  32.57 
 
 
419 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  33.44 
 
 
324 aa  152  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  31.53 
 
 
320 aa  151  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  34.23 
 
 
425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  28.23 
 
 
329 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  32.47 
 
 
436 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  30.91 
 
 
327 aa  148  3e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  31.09 
 
 
426 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  31.21 
 
 
311 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  33.65 
 
 
305 aa  147  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  33.04 
 
 
323 aa  144  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  31.09 
 
 
415 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  31.73 
 
 
424 aa  143  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.77 
 
 
418 aa  143  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  30.86 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.68 
 
 
328 aa  141  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  29.01 
 
 
417 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  29.07 
 
 
428 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
406 aa  138  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  33.92 
 
 
417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  32.14 
 
 
487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  29.33 
 
 
727 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  37.56 
 
 
460 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  37.56 
 
 
460 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  29.33 
 
 
331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  31.14 
 
 
328 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  30.56 
 
 
318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  28.85 
 
 
350 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  39.46 
 
 
456 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  39.46 
 
 
456 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  30.59 
 
 
417 aa  126  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  30.41 
 
 
416 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  28.29 
 
 
350 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  37.26 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  28.27 
 
 
657 aa  121  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  32.28 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.1 
 
 
451 aa  114  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  29.69 
 
 
348 aa  114  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  26.79 
 
 
320 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  28.74 
 
 
368 aa  113  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  27.19 
 
 
336 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  28.31 
 
 
474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  27.63 
 
 
491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  37.36 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  29.88 
 
 
345 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  31.72 
 
 
317 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  29.12 
 
 
335 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  28.88 
 
 
329 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  28.92 
 
 
447 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  26.6 
 
 
472 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  26.6 
 
 
472 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  27.11 
 
 
472 aa  104  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  27.11 
 
 
472 aa  104  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  27.7 
 
 
476 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  27.7 
 
 
476 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  27.7 
 
 
476 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  27.7 
 
 
476 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  27.11 
 
 
472 aa  104  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  27.11 
 
 
472 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  27.11 
 
 
472 aa  104  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  27.62 
 
 
476 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  29.69 
 
 
386 aa  103  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  27.13 
 
 
335 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 
490 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
444 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  26.72 
 
 
471 aa  101  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  26.13 
 
 
423 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.37 
 
 
312 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  27.62 
 
 
334 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  26.35 
 
 
423 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  30.15 
 
 
315 aa  97.4  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  34.81 
 
 
437 aa  97.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  26.33 
 
 
313 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  25.75 
 
 
325 aa  92.4  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  27 
 
 
454 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  26.93 
 
 
323 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  34.81 
 
 
350 aa  90.9  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  32.7 
 
 
413 aa  90.1  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  28.08 
 
 
427 aa  90.1  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.2 
 
 
357 aa  89.7  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  24.84 
 
 
313 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  29.47 
 
 
662 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  24.65 
 
 
390 aa  87.4  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  28.95 
 
 
398 aa  87  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  30.9 
 
 
406 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  26.18 
 
 
414 aa  86.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  24.46 
 
 
313 aa  86.3  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.45 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  28.7 
 
 
313 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  27.25 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  25.39 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  26.15 
 
 
468 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  26.55 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  32.57 
 
 
404 aa  84  0.000000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  24.4 
 
 
308 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  31.28 
 
 
440 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  31.28 
 
 
440 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>