158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0452 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0452  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
392 aa  816    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  hitchhiker  0.00155723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1588  DNA-cytosine methyltransferase  39.37 
 
 
385 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4240  DNA-cytosine methyltransferase  42.08 
 
 
387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481849  normal  0.893444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4756  DNA-cytosine methyltransferase  38.01 
 
 
375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1389  DNA-cytosine methyltransferase  34.56 
 
 
387 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376971  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4109  DNA-cytosine methyltransferase  35.98 
 
 
395 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560504  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0547  DNA-cytosine methyltransferase  37.27 
 
 
383 aa  190  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1810  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.85 
 
 
382 aa  188  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1337  DNA-cytosine methyltransferase  34.11 
 
 
393 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.911958 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1470  DNA-cytosine methyltransferase  30.85 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2261  DNA-cytosine methyltransferase  32 
 
 
387 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  29.26 
 
 
417 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.5 
 
 
418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
426 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.7 
 
 
328 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  26.29 
 
 
406 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  26.47 
 
 
428 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  26.51 
 
 
436 aa  108  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  26.86 
 
 
415 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  27.37 
 
 
323 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  25.27 
 
 
419 aa  106  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 
424 aa  101  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  25.35 
 
 
417 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  25.82 
 
 
324 aa  97.1  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  25.73 
 
 
413 aa  97.1  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  26.65 
 
 
425 aa  97.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  23.82 
 
 
416 aa  94  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  24.18 
 
 
329 aa  93.6  5e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  23.84 
 
 
417 aa  93.6  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  25.27 
 
 
329 aa  93.6  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  27.22 
 
 
487 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  25.27 
 
 
305 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  23.85 
 
 
350 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  33.91 
 
 
490 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  23.02 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  23.58 
 
 
350 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  26.42 
 
 
476 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  26.42 
 
 
476 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  26.42 
 
 
476 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  26.42 
 
 
476 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  26.42 
 
 
476 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  30.06 
 
 
239 aa  86.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  31.58 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.85 
 
 
435 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.93 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  30.77 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  32.54 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  30.36 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  24.32 
 
 
471 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  24.07 
 
 
472 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  24.07 
 
 
472 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  24.07 
 
 
472 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  24.07 
 
 
472 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  24.07 
 
 
472 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  24.5 
 
 
472 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  31.09 
 
 
427 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  26.32 
 
 
406 aa  80.9  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  24.43 
 
 
472 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  23.3 
 
 
491 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  24.32 
 
 
327 aa  79.3  0.0000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  28.5 
 
 
447 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  23.04 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  30.41 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  33.93 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  33.93 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  33.93 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  26.57 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  30.81 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  27.22 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  21.94 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  33.53 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  27.31 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  25.88 
 
 
727 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  25.86 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  24.73 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  26.63 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.47 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  25.88 
 
 
331 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  25.07 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  22.91 
 
 
373 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.33 
 
 
451 aa  67  0.0000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  24.37 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 
310 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  29.59 
 
 
389 aa  65.1  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  30.86 
 
 
438 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  29.17 
 
 
372 aa  63.9  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  27.57 
 
 
652 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  29.17 
 
 
437 aa  63.2  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  28.83 
 
 
320 aa  63.2  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  28.4 
 
 
495 aa  63.2  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  27.53 
 
 
335 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  23.37 
 
 
444 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
467 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl304  deoxycytosine methylase  32.17 
 
 
455 aa  61.6  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.2985e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  25.13 
 
 
313 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 
460 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 
460 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  23.39 
 
 
342 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  30 
 
 
657 aa  60.1  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  22.83 
 
 
404 aa  59.7  0.00000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>