215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl304 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl304  deoxycytosine methylase  100 
 
 
455 aa  929    Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.2985e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  31.69 
 
 
372 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  29.15 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  33.64 
 
 
321 aa  140  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1523  DNA-cytosine methyltransferase  30.61 
 
 
335 aa  102  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00206279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4397  modification methylase ScrFIB  29.45 
 
 
324 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.99 
 
 
435 aa  95.5  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  28.35 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.57 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  25.94 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1337  DNA-cytosine methyltransferase  36.44 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.911958 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.86 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  39.47 
 
 
483 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  26.61 
 
 
352 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  26.72 
 
 
305 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  26.96 
 
 
338 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  34.4 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  30.57 
 
 
427 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26 
 
 
451 aa  74.3  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  26.44 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  37.39 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  37.39 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  26.69 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  26.11 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  31.97 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  23.19 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  28.98 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  22.28 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  35.4 
 
 
335 aa  70.1  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  23.08 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  30.72 
 
 
315 aa  69.3  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  31.79 
 
 
490 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  31.58 
 
 
313 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  25.57 
 
 
431 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  25.07 
 
 
436 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  34.45 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  23.18 
 
 
350 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  20.82 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1810  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.82 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  37.5 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  34.45 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  22.97 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2261  DNA-cytosine methyltransferase  34.75 
 
 
387 aa  67  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  33.33 
 
 
423 aa  67  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  22.87 
 
 
418 aa  67  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  32.79 
 
 
632 aa  66.6  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  30.66 
 
 
345 aa  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  24.07 
 
 
424 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  25.71 
 
 
327 aa  66.2  0.000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  33.04 
 
 
416 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  25.87 
 
 
417 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  33.06 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  25.61 
 
 
318 aa  65.1  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  31.4 
 
 
662 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  34.21 
 
 
424 aa  64.3  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
308 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0566  DNA-cytosine methyltransferase  32.46 
 
 
449 aa  63.9  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.76321  normal  0.105811 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1470  DNA-cytosine methyltransferase  32.77 
 
 
411 aa  63.2  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  31.85 
 
 
335 aa  63.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  22.95 
 
 
426 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
487 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.2 
 
 
387 aa  62.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1588  DNA-cytosine methyltransferase  31.34 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  30.17 
 
 
460 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  30.17 
 
 
460 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0452  DNA-cytosine methyltransferase  32.17 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  hitchhiker  0.00155723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.74 
 
 
431 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  31.01 
 
 
467 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  22.25 
 
 
416 aa  61.6  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  31.91 
 
 
313 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  22.49 
 
 
329 aa  61.6  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1389  DNA-cytosine methyltransferase  30.23 
 
 
387 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376971  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  23.45 
 
 
491 aa  61.6  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  23.57 
 
 
474 aa  61.6  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  29.23 
 
 
657 aa  60.8  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  35.78 
 
 
380 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  31.5 
 
 
336 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  33.06 
 
 
319 aa  60.1  0.00000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.33 
 
 
362 aa  59.7  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  24.3 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  31.08 
 
 
320 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  23.57 
 
 
418 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  23.57 
 
 
418 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  26.88 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  34.55 
 
 
413 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4756  DNA-cytosine methyltransferase  21.13 
 
 
375 aa  58.9  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  23.24 
 
 
417 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2841  DNA-cytosine methyltransferase  22.53 
 
 
719 aa  58.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0393  DNA-cytosine methyltransferase  22.53 
 
 
719 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  24.15 
 
 
311 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  30.23 
 
 
356 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.16 
 
 
350 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.73 
 
 
362 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  29.23 
 
 
438 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  27.61 
 
 
456 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  27.61 
 
 
456 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  25.79 
 
 
317 aa  57  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  24.46 
 
 
727 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  29.75 
 
 
454 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>