52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pBT9727_0057 on replicon NC_006578
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006578  pBT9727_0057  phage-related DNA methylase, C-terminal region  100 
 
 
114 aa  235  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  63.06 
 
 
483 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  52.14 
 
 
437 aa  139  9e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  49.61 
 
 
451 aa  124  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  51.82 
 
 
444 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  43.55 
 
 
329 aa  58.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  53.57 
 
 
372 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  46.67 
 
 
352 aa  57.4  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  59.18 
 
 
415 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  49.15 
 
 
350 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  57.41 
 
 
417 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  53.7 
 
 
426 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  50.91 
 
 
427 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  56.86 
 
 
428 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  47.54 
 
 
350 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  54.1 
 
 
418 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  54.9 
 
 
323 aa  52.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  50 
 
 
406 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  50.88 
 
 
474 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  58.93 
 
 
491 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  37.1 
 
 
318 aa  52.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  32.99 
 
 
383 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  38.71 
 
 
311 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  50.98 
 
 
328 aa  50.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  49.06 
 
 
416 aa  50.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  58 
 
 
436 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  46.67 
 
 
373 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  49.02 
 
 
419 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  54.9 
 
 
305 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  37.08 
 
 
338 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1422  DNA-cytosine methyltransferase  34.04 
 
 
365 aa  46.2  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0062681  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  52.94 
 
 
320 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  47.17 
 
 
350 aa  45.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  44.26 
 
 
424 aa  45.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1499  DNA-cytosine methyltransferase  44 
 
 
703 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl304  deoxycytosine methylase  36.11 
 
 
455 aa  43.9  0.0007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.2985e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  43.14 
 
 
417 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1523  DNA-cytosine methyltransferase  36.62 
 
 
335 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00206279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3912  DNA-cytosine methyltransferase  37.66 
 
 
553 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.286893  hitchhiker  0.00120484 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  36.21 
 
 
321 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  35.85 
 
 
324 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0465  DNA-cytosine methyltransferase  40.35 
 
 
490 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  37.74 
 
 
456 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  48.89 
 
 
472 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  48.89 
 
 
472 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  48.89 
 
 
472 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  48.89 
 
 
472 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  48.89 
 
 
472 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  39.66 
 
 
389 aa  40.8  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  42.86 
 
 
416 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  35.71 
 
 
331 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  52.5 
 
 
471 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>