218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0465 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0465  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
490 aa  1012    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1656  DNA-cytosine methyltransferase  77.1 
 
 
487 aa  754    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1222  C-5 cytosine-specific DNA methylase  63.21 
 
 
533 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1309  C-5 cytosine-specific DNA methylase  60.93 
 
 
539 aa  595  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.130072  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1444  C-5 cytosine-specific DNA methylase  60.93 
 
 
539 aa  595  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0557  DNA-cytosine methyltransferase  56.36 
 
 
486 aa  523  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3912  DNA-cytosine methyltransferase  48.24 
 
 
553 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.286893  hitchhiker  0.00120484 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1422  DNA-cytosine methyltransferase  53.04 
 
 
365 aa  249  9e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0062681  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1364  DNA methyltransferase  35.12 
 
 
535 aa  226  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513353  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0263  DNA-cytosine methyltransferase  32.59 
 
 
555 aa  196  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343546  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1499  DNA-cytosine methyltransferase  35.74 
 
 
703 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0393  DNA-cytosine methyltransferase  34.02 
 
 
719 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2841  DNA-cytosine methyltransferase  33.47 
 
 
719 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  29 
 
 
437 aa  87.8  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  31.19 
 
 
460 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  31.19 
 
 
460 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  28.57 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  28.18 
 
 
315 aa  79.7  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.13 
 
 
328 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  26.42 
 
 
324 aa  77.8  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  29.3 
 
 
389 aa  76.6  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  27.86 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.35 
 
 
451 aa  76.6  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  28.14 
 
 
338 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4216  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.51 
 
 
329 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.757892  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  27.36 
 
 
350 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  29.53 
 
 
490 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  29.02 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  28.86 
 
 
373 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  31 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  26.25 
 
 
350 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
318 aa  72.4  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  27.46 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.43 
 
 
308 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0566  DNA-cytosine methyltransferase  26.21 
 
 
449 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.76321  normal  0.105811 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  26.9 
 
 
327 aa  72.4  0.00000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  28.08 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  26.09 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  27.41 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  30.53 
 
 
423 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  25 
 
 
320 aa  69.3  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  24.38 
 
 
311 aa  68.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  24.87 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  26.6 
 
 
313 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 
370 aa  67  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  27.18 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.3 
 
 
362 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  28.93 
 
 
468 aa  66.6  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  27.09 
 
 
465 aa  66.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  28.36 
 
 
446 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  24.38 
 
 
727 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0330  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.47 
 
 
253 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0129199  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  29.8 
 
 
406 aa  65.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  32.37 
 
 
368 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  24.38 
 
 
331 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.5 
 
 
431 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  28.35 
 
 
365 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
487 aa  64.3  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 
329 aa  63.9  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
356 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.12 
 
 
283 aa  63.9  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.57 
 
 
415 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  26.6 
 
 
352 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  29.45 
 
 
438 aa  62.4  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3531  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.78 
 
 
259 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3814  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.78 
 
 
259 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  28.43 
 
 
662 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  28.99 
 
 
380 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  31.16 
 
 
361 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  25.77 
 
 
416 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
328 aa  62.4  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  29.55 
 
 
310 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.66 
 
 
357 aa  61.2  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  25.5 
 
 
421 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  34.29 
 
 
348 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3450  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.01 
 
 
251 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189675  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  28.21 
 
 
388 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.27 
 
 
395 aa  60.1  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  33.58 
 
 
398 aa  60.1  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
426 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.23 
 
 
435 aa  58.9  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4158  hypothetical protein  64.1 
 
 
108 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.596176  normal  0.333487 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  31.25 
 
 
495 aa  59.3  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  26.17 
 
 
425 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  30.5 
 
 
385 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  29.71 
 
 
488 aa  58.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  25.56 
 
 
444 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
483 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.54 
 
 
236 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  24.12 
 
 
434 aa  57.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  24.27 
 
 
415 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  24.64 
 
 
334 aa  58.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.15 
 
 
387 aa  57.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  28.66 
 
 
320 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>