261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4216 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4216  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 
329 aa  650    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.757892  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  42.47 
 
 
236 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.03 
 
 
283 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3531  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  34.09 
 
 
259 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3814  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  34.09 
 
 
259 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3450  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.52 
 
 
251 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2140  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.21 
 
 
316 aa  98.2  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0199613  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0330  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.03 
 
 
253 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0129199  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  34.78 
 
 
460 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  34.78 
 
 
460 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  29.35 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  32.1 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  27.33 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.89 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  28.22 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6177  DNA-cytosine methyltransferase  27.42 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  31.1 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1656  DNA-cytosine methyltransferase  33.68 
 
 
487 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  32.16 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  28.85 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  37.74 
 
 
451 aa  76.3  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  30.72 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  30.91 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0465  DNA-cytosine methyltransferase  33.51 
 
 
490 aa  76.3  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  25.96 
 
 
318 aa  76.3  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  31.93 
 
 
416 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  30.13 
 
 
327 aa  76.3  0.0000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  31.95 
 
 
456 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  30.12 
 
 
311 aa  75.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  34.51 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  28.66 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  31.95 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1222  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.38 
 
 
533 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1523  DNA-cytosine methyltransferase  29.88 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00206279  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  29.88 
 
 
324 aa  73.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  24.16 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  26.7 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2321  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.46 
 
 
287 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.343948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  31.85 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1364  DNA methyltransferase  35.98 
 
 
535 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513353  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  35.67 
 
 
662 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.06 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0557  DNA-cytosine methyltransferase  33.67 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  28.32 
 
 
417 aa  70.1  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1309  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.33 
 
 
539 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.130072  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1444  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.33 
 
 
539 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.75 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  37.11 
 
 
437 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  31.29 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  26.06 
 
 
727 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  25.47 
 
 
489 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  30.9 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1422  DNA-cytosine methyltransferase  31.58 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0062681  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  29.27 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  23.17 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  30.18 
 
 
657 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  28.66 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  30.19 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  30.38 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  27.12 
 
 
416 aa  67  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1541  methyltransferase, putative  32.02 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0775006 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.16 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  26.38 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  32.3 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  26.54 
 
 
335 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  28.82 
 
 
350 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  25.45 
 
 
331 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  24.07 
 
 
323 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  25 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  27.71 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  31.21 
 
 
389 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.75 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  26.8 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.18 
 
 
415 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  31.58 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  27.22 
 
 
468 aa  64.3  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  31.29 
 
 
490 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_25785  predicted protein  27.48 
 
 
778 aa  63.2  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00893206 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  28.75 
 
 
328 aa  63.2  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  28.82 
 
 
350 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  31.48 
 
 
390 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  28.91 
 
 
313 aa  62.8  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  36.27 
 
 
418 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  28.48 
 
 
342 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  28.3 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  27.67 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.4 
 
 
345 aa  61.6  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  32.43 
 
 
409 aa  61.2  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  31.82 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  32 
 
 
355 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  31.67 
 
 
412 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  29.26 
 
 
389 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
386 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  26.26 
 
 
373 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  31.82 
 
 
418 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  31.3 
 
 
483 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  31.82 
 
 
418 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0869  putative cytosine-specific methyltransferase protein  34.78 
 
 
194 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0279649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  28.82 
 
 
467 aa  60.1  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0166825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>