211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0330 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0330  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 
253 aa  523  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0129199  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.36 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.76 
 
 
236 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4216  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.03 
 
 
329 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.757892  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
423 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  34.3 
 
 
437 aa  85.9  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
423 aa  86.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3450  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.05 
 
 
251 aa  85.5  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189675  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.52 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  31.52 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  30.23 
 
 
438 aa  81.3  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.4 
 
 
451 aa  79.7  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3531  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.55 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3814  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.55 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  30.9 
 
 
727 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  32.73 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  33.33 
 
 
315 aa  79  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  32.97 
 
 
468 aa  77  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  30.34 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  29.09 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  29.09 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.45 
 
 
362 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  32.16 
 
 
490 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 
460 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 
460 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6177  DNA-cytosine methyltransferase  37.4 
 
 
390 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  30.56 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  28.81 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  32.12 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  27.61 
 
 
456 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  27.61 
 
 
456 aa  72  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  30.59 
 
 
416 aa  72  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  33.87 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  29.41 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.74 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  27.04 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  32.62 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  27.89 
 
 
328 aa  70.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  30.68 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1270  DNA-cytosine methyltransferase  31.22 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.99 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.42 
 
 
405 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  28.74 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  26.49 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  29.76 
 
 
311 aa  68.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  28.98 
 
 
483 aa  67  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  27.71 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  28.66 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  27.98 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 
335 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0979  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.92 
 
 
484 aa  66.2  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.441427  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  23.9 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  29.65 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0465  DNA-cytosine methyltransferase  29.47 
 
 
490 aa  65.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.4 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3504  BsaWI methylase  29.93 
 
 
440 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.671295  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  28.66 
 
 
318 aa  65.5  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  26.98 
 
 
373 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  23.74 
 
 
373 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 
334 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  28.04 
 
 
395 aa  63.5  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
313 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3182  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.09 
 
 
495 aa  63.5  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 
318 aa  63.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1925  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.3 
 
 
98 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302463  hitchhiker  0.00908439 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_25785  predicted protein  28.42 
 
 
778 aa  62.8  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00893206 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  29.94 
 
 
319 aa  62.4  0.000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  25.85 
 
 
338 aa  62.4  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  28.57 
 
 
345 aa  62  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  32.2 
 
 
336 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  32.16 
 
 
389 aa  62  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  26.34 
 
 
320 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1322  DNA-cytosine methyltransferase  29.63 
 
 
429 aa  61.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000848316  hitchhiker  0.000198005 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  29.59 
 
 
320 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4397  modification methylase ScrFIB  26.98 
 
 
324 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  28.09 
 
 
368 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  23.35 
 
 
489 aa  62  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.34 
 
 
362 aa  62  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 
385 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.86 
 
 
387 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0082  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.4 
 
 
424 aa  60.8  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.00000000201074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  27.84 
 
 
416 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1656  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 
487 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  28.02 
 
 
657 aa  60.5  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  28.06 
 
 
632 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  26.46 
 
 
417 aa  60.1  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  29.65 
 
 
317 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  25.48 
 
 
361 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  28.37 
 
 
370 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3372  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.48 
 
 
502 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1309  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.47 
 
 
539 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.130072  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1444  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.47 
 
 
539 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  27.62 
 
 
381 aa  58.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 
359 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  29.05 
 
 
446 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1222  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.42 
 
 
533 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3912  DNA-cytosine methyltransferase  28.43 
 
 
553 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.286893  hitchhiker  0.00120484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  25.69 
 
 
415 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  25.13 
 
 
352 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>