212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1925 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1925  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 98 aa  200  4e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302463  hitchhiker  0.00908439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  87.76 
 
 		 236 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  50 
 
 		 283 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  43.62 
 
 		 437 aa  78.2  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  38.54 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  38.54 
 
 		 727 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  47.62 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  47.62 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3531  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  36.46 
 
 		 259 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3814  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  36.46 
 
 		 259 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  37.36 
 
 		 490 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.3 
 
 		 451 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  38.37 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3450  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.42 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189675  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  38.64 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  38.64 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  40.43 
 
 		 423 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  40.43 
 
 		 423 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  40.82 
 
 		 434 aa  63.9  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  43.88 
 
 		 415 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1309  C-5 cytosine-specific DNA methylase  40.22 
 
 		 539 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.130072  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1444  C-5 cytosine-specific DNA methylase  40.22 
 
 		 539 aa  63.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_25785  predicted protein  44.71 
 
 		 778 aa  63.5  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00893206 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0330  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.3 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0129199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  34.34 
 
 		 465 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  44.44 
 
 		 431 aa  61.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  35.8 
 
 		 427 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  41.49 
 
 		 632 aa  60.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1222  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.04 
 
 		 533 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  38 
 
 		 662 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0979  C-5 cytosine-specific DNA methylase  45.26 
 
 		 484 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.441427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2442  DNA-cytosine methyltransferase  37.04 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.767774  unclonable  0.00000000055978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  42 
 
 		 431 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  38.64 
 
 		 389 aa  58.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  31.25 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  43.02 
 
 		 380 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1656  DNA-cytosine methyltransferase  38 
 
 		 487 aa  58.2  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24513  predicted protein  37.65 
 
 		 820 aa  58.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.558259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  35.96 
 
 		 460 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  35.96 
 
 		 460 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  40.78 
 
 		 446 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  40.62 
 
 		 671 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  35.48 
 
 		 418 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  37.93 
 
 		 350 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0465  DNA-cytosine methyltransferase  32.63 
 
 		 490 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  35.42 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  39.22 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  32.98 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  39.56 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3912  DNA-cytosine methyltransferase  36.96 
 
 		 553 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.286893  hitchhiker  0.00120484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  38.3 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  38.54 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  37.76 
 
 		 421 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  39.33 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0134  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  40.21 
 
 		 539 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.191643  normal  0.811146 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  38.54 
 
 		 418 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  34.31 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  33.71 
 
 		 467 aa  55.5  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3182  C-5 cytosine-specific DNA methylase  41.57 
 
 		 495 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  31.82 
 
 		 311 aa  54.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.36 
 
 		 328 aa  54.7  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  32.35 
 
 		 657 aa  55.1  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  38.2 
 
 		 483 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  32.97 
 
 		 327 aa  54.3  0.0000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  34.69 
 
 		 377 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  39.02 
 
 		 487 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  34.34 
 
 		 360 aa  53.9  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  35.9 
 
 		 492 aa  53.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  33.67 
 
 		 468 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  35.23 
 
 		 495 aa  53.9  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  36.78 
 
 		 350 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  39.13 
 
 		 440 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  32.97 
 
 		 313 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3372  C-5 cytosine-specific DNA methylase  40.45 
 
 		 502 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  39.13 
 
 		 440 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  38.54 
 
 		 342 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  37.04 
 
 		 419 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  36.36 
 
 		 438 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  36.46 
 
 		 370 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  31.31 
 
 		 489 aa  52.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  34.95 
 
 		 348 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  36.63 
 
 		 395 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  30.53 
 
 		 413 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  30.85 
 
 		 438 aa  52.4  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  39.58 
 
 		 318 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  31.91 
 
 		 305 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  39.36 
 
 		 365 aa  52  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  35.23 
 
 		 417 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  33.7 
 
 		 409 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  33.94 
 
 		 398 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  40.43 
 
 		 320 aa  51.2  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  36.59 
 
 		 652 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  34.07 
 
 		 335 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  40 
 
 		 415 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  34.07 
 
 		 310 aa  50.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  34.15 
 
 		 426 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  30.68 
 
 		 338 aa  50.8  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  37.23 
 
 		 359 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  36.05 
 
 		 416 aa  50.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>