184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1309 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1222  C-5 cytosine-specific DNA methylase  84.07 
 
 
533 aa  890    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1309  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 
539 aa  1088    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.130072  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1444  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 
539 aa  1088    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1656  DNA-cytosine methyltransferase  64.8 
 
 
487 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0557  DNA-cytosine methyltransferase  64.13 
 
 
486 aa  624  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0465  DNA-cytosine methyltransferase  60.93 
 
 
490 aa  581  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3912  DNA-cytosine methyltransferase  42.19 
 
 
553 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.286893  hitchhiker  0.00120484 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1364  DNA methyltransferase  38.99 
 
 
535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513353  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1422  DNA-cytosine methyltransferase  54.39 
 
 
365 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0062681  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0263  DNA-cytosine methyltransferase  35.13 
 
 
555 aa  230  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343546  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1499  DNA-cytosine methyltransferase  35.97 
 
 
703 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0393  DNA-cytosine methyltransferase  34.75 
 
 
719 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2841  DNA-cytosine methyltransferase  34.45 
 
 
719 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  28.5 
 
 
437 aa  77  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  30.62 
 
 
315 aa  76.6  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  29.15 
 
 
350 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  28.44 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  31.41 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  28.44 
 
 
490 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  28.14 
 
 
350 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.45 
 
 
328 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  29.1 
 
 
313 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  23.15 
 
 
331 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4216  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.51 
 
 
329 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.757892  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  27.66 
 
 
335 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
389 aa  67  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  22.66 
 
 
727 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  25.79 
 
 
305 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.05 
 
 
236 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  32.62 
 
 
368 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 
446 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 
456 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  26.96 
 
 
318 aa  65.1  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 
456 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.78 
 
 
451 aa  64.7  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  29.74 
 
 
460 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  29.74 
 
 
460 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  31.06 
 
 
311 aa  64.3  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  32.67 
 
 
385 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  32.67 
 
 
385 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 
438 aa  63.9  0.000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  26.26 
 
 
417 aa  63.5  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  32.31 
 
 
662 aa  63.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  26.84 
 
 
313 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  31.87 
 
 
370 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  23.28 
 
 
324 aa  62.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1925  C-5 cytosine-specific DNA methylase  40.22 
 
 
98 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302463  hitchhiker  0.00908439 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  25.39 
 
 
416 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  26.56 
 
 
335 aa  62.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  27.92 
 
 
308 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  28.21 
 
 
320 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.79 
 
 
283 aa  62  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  27.51 
 
 
373 aa  61.6  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  27.6 
 
 
319 aa  61.2  0.00000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  29.32 
 
 
350 aa  61.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3531  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  36.67 
 
 
259 aa  60.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3814  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  36.67 
 
 
259 aa  60.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  29.85 
 
 
328 aa  60.5  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
361 aa  60.5  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  27.94 
 
 
352 aa  60.1  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.02 
 
 
415 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  27.45 
 
 
438 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  23.15 
 
 
338 aa  60.1  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  29.5 
 
 
488 aa  59.7  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  27.73 
 
 
362 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0330  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.47 
 
 
253 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0129199  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  25.4 
 
 
406 aa  58.9  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  29.26 
 
 
365 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  35.71 
 
 
518 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3450  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.26 
 
 
251 aa  59.3  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189675  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  30.26 
 
 
320 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  26.56 
 
 
416 aa  58.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  26.46 
 
 
415 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.71 
 
 
405 aa  57.4  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  36.57 
 
 
398 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  25.9 
 
 
489 aa  57.4  0.0000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.78 
 
 
387 aa  57.4  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  28.15 
 
 
395 aa  57  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0566  DNA-cytosine methyltransferase  30.49 
 
 
449 aa  57  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.76321  normal  0.105811 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  25.91 
 
 
329 aa  57  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  34.38 
 
 
381 aa  57  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  27.6 
 
 
383 aa  57  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  28.36 
 
 
380 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.8 
 
 
423 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  23.19 
 
 
329 aa  56.2  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24513  predicted protein  27.19 
 
 
820 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.558259  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  26.42 
 
 
487 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
423 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.6 
 
 
357 aa  55.8  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  25.95 
 
 
418 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  33.58 
 
 
508 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4158  hypothetical protein  58.97 
 
 
108 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.596176  normal  0.333487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  25.95 
 
 
418 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  28 
 
 
450 aa  54.7  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25 
 
 
431 aa  54.7  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.54 
 
 
405 aa  54.7  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  22.92 
 
 
327 aa  54.7  0.000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1523  DNA-cytosine methyltransferase  26.92 
 
 
335 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00206279  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  29.93 
 
 
483 aa  54.7  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  30.72 
 
 
385 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>