216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1422 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1422  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
365 aa  758    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0062681  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1309  C-5 cytosine-specific DNA methylase  59.62 
 
 
539 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.130072  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1444  C-5 cytosine-specific DNA methylase  59.62 
 
 
539 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1222  C-5 cytosine-specific DNA methylase  59.72 
 
 
533 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3912  DNA-cytosine methyltransferase  56.44 
 
 
553 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.286893  hitchhiker  0.00120484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0465  DNA-cytosine methyltransferase  56.54 
 
 
490 aa  248  8e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1656  DNA-cytosine methyltransferase  57.28 
 
 
487 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0557  DNA-cytosine methyltransferase  59.13 
 
 
486 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1364  DNA methyltransferase  46.54 
 
 
535 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1499  DNA-cytosine methyltransferase  35.89 
 
 
703 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  30.73 
 
 
350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  31 
 
 
350 aa  126  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2841  DNA-cytosine methyltransferase  32.06 
 
 
719 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0393  DNA-cytosine methyltransferase  32.06 
 
 
719 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0263  DNA-cytosine methyltransferase  34.32 
 
 
555 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343546  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  31 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 
329 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  26.5 
 
 
311 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  26.92 
 
 
318 aa  105  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  28.85 
 
 
315 aa  103  6e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
324 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  28.7 
 
 
490 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 
427 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
389 aa  100  3e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  28.1 
 
 
305 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  26.96 
 
 
352 aa  90.9  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.27 
 
 
328 aa  88.6  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  23.97 
 
 
727 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  25.64 
 
 
327 aa  85.1  0.000000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  23.14 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  25.34 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  24.44 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  26.74 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  31.98 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  31.98 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  25.94 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  26.55 
 
 
313 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  23.75 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  26.86 
 
 
313 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  24.4 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  25.75 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  23.33 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  24.02 
 
 
426 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  26.35 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  28.13 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  32.56 
 
 
361 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  25.39 
 
 
465 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  25.32 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  29.11 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  29.11 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 
390 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0840  modification methylase DdeI; cytosine-specific methyltransferase  27.91 
 
 
450 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  3.27192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  24.63 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  22.75 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  24.64 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  29.48 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  28.27 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  24.13 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.79 
 
 
418 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4216  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.58 
 
 
329 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.757892  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  25.98 
 
 
417 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  23.06 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  25.44 
 
 
390 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  25.73 
 
 
359 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  24.38 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  24.27 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  26.16 
 
 
321 aa  65.5  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  24.63 
 
 
428 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4397  modification methylase ScrFIB  27.95 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.56 
 
 
451 aa  64.3  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0566  DNA-cytosine methyltransferase  33.79 
 
 
449 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.76321  normal  0.105811 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  24.33 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  24.33 
 
 
385 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  31.06 
 
 
390 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  25.66 
 
 
356 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  23.08 
 
 
388 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  25.81 
 
 
362 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  26.07 
 
 
348 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  26.48 
 
 
436 aa  61.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  22.07 
 
 
495 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  24.92 
 
 
370 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  29.93 
 
 
406 aa  60.8  0.00000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  29.93 
 
 
483 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  23.08 
 
 
398 aa  60.5  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  33.09 
 
 
412 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  24.44 
 
 
336 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  24.46 
 
 
415 aa  59.7  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  29.32 
 
 
468 aa  58.9  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.9 
 
 
431 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  27 
 
 
657 aa  58.9  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.49 
 
 
434 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  31.47 
 
 
395 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  25.13 
 
 
417 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  28.9 
 
 
446 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3450  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.5 
 
 
251 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189675  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  25.54 
 
 
443 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.94 
 
 
283 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  33.83 
 
 
488 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  31.2 
 
 
423 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>