191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0557 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0557  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
486 aa  973    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1309  C-5 cytosine-specific DNA methylase  63.55 
 
 
539 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.130072  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1444  C-5 cytosine-specific DNA methylase  63.55 
 
 
539 aa  614  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1222  C-5 cytosine-specific DNA methylase  64.37 
 
 
533 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1656  DNA-cytosine methyltransferase  62.09 
 
 
487 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0465  DNA-cytosine methyltransferase  56.36 
 
 
490 aa  505  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3912  DNA-cytosine methyltransferase  42.65 
 
 
553 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.286893  hitchhiker  0.00120484 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1422  DNA-cytosine methyltransferase  59.13 
 
 
365 aa  243  6e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0062681  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1364  DNA methyltransferase  38.17 
 
 
535 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513353  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0263  DNA-cytosine methyltransferase  34.31 
 
 
555 aa  209  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343546  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2841  DNA-cytosine methyltransferase  34.23 
 
 
719 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1499  DNA-cytosine methyltransferase  32.81 
 
 
703 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0393  DNA-cytosine methyltransferase  33.19 
 
 
719 aa  113  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.31 
 
 
451 aa  83.2  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 
427 aa  82  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  25.9 
 
 
315 aa  77  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  28.97 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  28.27 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.04 
 
 
328 aa  72.8  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  26.84 
 
 
305 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  28.5 
 
 
437 aa  72  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3442  DNA-cytosine methyltransferase  31.67 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.836948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
490 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  25.76 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  27.48 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4216  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.38 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.757892  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1523  DNA-cytosine methyltransferase  28.02 
 
 
335 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00206279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  25.76 
 
 
350 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  28.36 
 
 
417 aa  69.7  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  25 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  35.51 
 
 
370 aa  67.8  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 
361 aa  67  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  25.23 
 
 
329 aa  67  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  28.19 
 
 
335 aa  67  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  28.02 
 
 
460 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  28.02 
 
 
460 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 
456 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  24.76 
 
 
329 aa  65.9  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  28.8 
 
 
456 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  20.81 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  27.62 
 
 
438 aa  65.9  0.000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 
338 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2232  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.16 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.996757  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  26.6 
 
 
465 aa  64.7  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  28.99 
 
 
443 aa  63.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  26.77 
 
 
335 aa  62.8  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0817  DNA-cytosine methyltransferase  31.84 
 
 
385 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0833  DNA-cytosine methyltransferase  31.84 
 
 
385 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 
350 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  23.15 
 
 
727 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  25 
 
 
313 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  26.26 
 
 
308 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  26.92 
 
 
487 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  31.51 
 
 
348 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  26.4 
 
 
313 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  23.27 
 
 
331 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  29.81 
 
 
352 aa  61.2  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 
311 aa  60.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.7 
 
 
415 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  30.88 
 
 
368 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  27.69 
 
 
662 aa  60.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2521  modification methylase DdeI  35.34 
 
 
518 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  26.56 
 
 
416 aa  60.1  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  25.7 
 
 
320 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  26.47 
 
 
320 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  23 
 
 
438 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  28.42 
 
 
385 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  27.8 
 
 
423 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  28.32 
 
 
446 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  26.7 
 
 
362 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  31.3 
 
 
328 aa  58.2  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  27.75 
 
 
319 aa  58.5  0.0000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.85 
 
 
283 aa  58.2  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.96 
 
 
357 aa  58.2  0.0000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  27.66 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0766  DNA-cytosine methyltransferase  29.37 
 
 
488 aa  57.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  27.34 
 
 
321 aa  57  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  26.15 
 
 
395 aa  56.6  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2858  DNA-cytosine methyltransferase  24.77 
 
 
502 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.568201  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0566  DNA-cytosine methyltransferase  34.06 
 
 
449 aa  56.2  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.76321  normal  0.105811 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  25.73 
 
 
419 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  30.1 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  25.74 
 
 
310 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  25.12 
 
 
657 aa  55.1  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.3 
 
 
435 aa  55.1  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  30.18 
 
 
356 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3531  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.2 
 
 
259 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3814  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.2 
 
 
259 aa  54.7  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  28.48 
 
 
407 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  25.33 
 
 
425 aa  54.3  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 
417 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  30.37 
 
 
381 aa  54.7  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  30.84 
 
 
398 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  33.33 
 
 
236 aa  54.3  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3450  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.47 
 
 
251 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189675  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  31.77 
 
 
390 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  32.17 
 
 
393 aa  53.9  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  26.56 
 
 
483 aa  53.9  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>