98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2140 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2140  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 316 aa  630  1e-180  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0199613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0230  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.87 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4216  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.31 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.757892  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.77 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  29.46 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  38.52 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  27.54 
 
 		 727 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  30.08 
 
 		 338 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  31.33 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  31.97 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  31.75 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  32.2 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  36.57 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  33.07 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.96 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 		 416 aa  62.8  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  30.23 
 
 		 323 aa  62.8  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  33.86 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  32.14 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  28.67 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  28.76 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  31.43 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  32.2 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  30.09 
 
 		 495 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1499  DNA-cytosine methyltransferase  31.54 
 
 		 703 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  29.37 
 
 		 379 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  30.6 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  25.5 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1364  DNA methyltransferase  32.99 
 
 		 535 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.513353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  25.62 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  32.45 
 
 		 428 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  26.36 
 
 		 406 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  29.66 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  27.01 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1222  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.13 
 
 		 533 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  34.45 
 
 		 437 aa  54.3  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  28.7 
 
 		 318 aa  53.1  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  29.91 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  25.62 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2841  DNA-cytosine methyltransferase  30.15 
 
 		 719 aa  52.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0393  DNA-cytosine methyltransferase  30.15 
 
 		 719 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 324 aa  52.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  29.75 
 
 		 416 aa  52.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1309  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.96 
 
 		 539 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.130072  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1444  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.96 
 
 		 539 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.08 
 
 		 451 aa  52.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0557  DNA-cytosine methyltransferase  35.56 
 
 		 486 aa  52.4  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  31.88 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  27.03 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  24.55 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  26.09 
 
 		 373 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  25.44 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  27.05 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  23.91 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  30.89 
 
 		 417 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  31.19 
 
 		 383 aa  50.8  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 		 426 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0330  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.9 
 
 		 253 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0129199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  30.3 
 
 		 465 aa  50.1  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1656  DNA-cytosine methyltransferase  31.69 
 
 		 487 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0465  DNA-cytosine methyltransferase  32.62 
 
 		 490 aa  49.7  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3450  C-5 cytosine-specific DNA methylase  21.76 
 
 		 251 aa  49.3  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.189675  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_25785  predicted protein  31.36 
 
 		 778 aa  49.3  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00893206 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0056  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  32.93 
 
 		 88 aa  49.3  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  23.13 
 
 		 438 aa  49.3  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.67 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  27.59 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1422  DNA-cytosine methyltransferase  32.41 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0062681  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  26.92 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  26.47 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  27.15 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 		 460 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 		 460 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  28.45 
 
 		 456 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  28.46 
 
 		 350 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.37 
 
 		 350 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  28.45 
 
 		 456 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  27.13 
 
 		 417 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  29.5 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3531  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  20.56 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3814  prophage LambdaBa01, C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  20.56 
 
 		 259 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  30.4 
 
 		 409 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  27.17 
 
 		 474 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  26.28 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  27.33 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  26.62 
 
 		 370 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0263  DNA-cytosine methyltransferase  32.99 
 
 		 555 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  28.23 
 
 		 657 aa  43.9  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  23.94 
 
 		 467 aa  43.5  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  25.58 
 
 		 361 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  29.32 
 
 		 468 aa  43.5  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  29.27 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  28.89 
 
 		 395 aa  43.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1925  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.95 
 
 		 98 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302463  hitchhiker  0.00908439 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  26.23 
 
 		 419 aa  42.7  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>