71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0568 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0568  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 553 aa  1139    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0234117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5574  C-5 cytosine-specific DNA methylase  47.9 
 
 		 496 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6268  C-5 cytosine-specific DNA methylase  41.68 
 
 		 552 aa  369  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3037  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.74 
 
 		 483 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0129697  normal  0.245214 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4776  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.83 
 
 		 615 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.034234 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3461  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.69 
 
 		 687 aa  176  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4922  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.11 
 
 		 652 aa  169  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3654  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.02 
 
 		 494 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4058  C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.82 
 
 		 438 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0980  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.4 
 
 		 488 aa  110  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.407551  hitchhiker  0.0000325424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1917  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.04 
 
 		 535 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.92455  normal  0.374422 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2003  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.33 
 
 		 516 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00321659  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1961  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.82 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0550818  normal  0.0497342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3506  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.16 
 
 		 516 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.39459  hitchhiker  0.00149895 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4214  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.32 
 
 		 304 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000361487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2731  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.66 
 
 		 668 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1360  type II restriction-modification system DNA cytosine-specific methylase  59.74 
 
 		 78 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000045922  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2386  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  38.12 
 
 		 295 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0340074  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1740  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.68 
 
 		 669 aa  94.4  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313379 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3006  prophage LambdaSo, type II DNA modification methyltransferase, putative  24.65 
 
 		 557 aa  93.6  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3427  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  23.91 
 
 		 594 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.00000565023  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5090  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.24 
 
 		 618 aa  90.1  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3699  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.15 
 
 		 579 aa  89  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1040  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.89 
 
 		 659 aa  87.4  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.172605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2449  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.39 
 
 		 646 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.199486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2642  C-5 cytosine-specific DNA methylase  22.26 
 
 		 555 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000523714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1691  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.85 
 
 		 697 aa  80.9  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1680  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24 
 
 		 710 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3461  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.07 
 
 		 619 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000315602 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0012  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.3 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.684081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2843  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.5 
 
 		 710 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0878273 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.03 
 
 		 328 aa  62.4  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  28.95 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2828  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.08 
 
 		 684 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.645339 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  26.02 
 
 		 323 aa  58.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  26.48 
 
 		 487 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3029  DNA cytosine methyltransferase family protein  24.83 
 
 		 609 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0585199 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  25.37 
 
 		 324 aa  55.1  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 		 416 aa  53.5  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  26.6 
 
 		 319 aa  53.1  0.00001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  25.66 
 
 		 416 aa  53.5  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  29.31 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2924  DNA-cytosine methyltransferase  31.31 
 
 		 537 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  38.46 
 
 		 489 aa  51.2  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  25.23 
 
 		 417 aa  51.2  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1539  DNA-cytosine methyltransferase  44.23 
 
 		 569 aa  50.8  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0450  DNA-cytosine methyltransferase  25.12 
 
 		 452 aa  50.4  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.618512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  22.17 
 
 		 390 aa  50.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  32.41 
 
 		 348 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  26.5 
 
 		 327 aa  50.1  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  23.53 
 
 		 417 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  25.5 
 
 		 358 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  25.82 
 
 		 365 aa  48.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  23.68 
 
 		 435 aa  48.5  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  26.64 
 
 		 436 aa  48.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  25.79 
 
 		 417 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  26.48 
 
 		 500 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  24.74 
 
 		 239 aa  47.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  23.53 
 
 		 350 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  27.14 
 
 		 419 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  25.48 
 
 		 414 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0452  DNA-cytosine methyltransferase  24.77 
 
 		 392 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  hitchhiker  0.00155723 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  26.89 
 
 		 615 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.25 
 
 		 357 aa  45.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  31.33 
 
 		 312 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4938  DNA-cytosine methyltransferase  26.02 
 
 		 355 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  23.04 
 
 		 325 aa  45.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  23.04 
 
 		 350 aa  43.9  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  25.45 
 
 		 415 aa  43.5  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>