More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0056 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  42.42 
 
 		 936 aa  786    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  46.53 
 
 		 954 aa  842    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  42.65 
 
 		 937 aa  734    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  45.35 
 
 		 955 aa  832    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  100 
 
 		 938 aa  1931    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  34.96 
 
 		 928 aa  537  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  31.43 
 
 		 941 aa  472  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  31.92 
 
 		 932 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  29.12 
 
 		 938 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  28.02 
 
 		 912 aa  330  8e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  28.82 
 
 		 933 aa  319  1e-85  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  28.31 
 
 		 912 aa  315  3.9999999999999997e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  26.46 
 
 		 992 aa  304  4.0000000000000003e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  26.75 
 
 		 915 aa  268  2.9999999999999995e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  26.5 
 
 		 927 aa  262  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  26.39 
 
 		 927 aa  262  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  26.39 
 
 		 927 aa  261  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  26.5 
 
 		 927 aa  261  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  26.39 
 
 		 931 aa  261  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  26.39 
 
 		 931 aa  261  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  25.84 
 
 		 927 aa  260  7e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  26.37 
 
 		 926 aa  258  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  26.39 
 
 		 927 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  23.96 
 
 		 927 aa  255  3e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  23.8 
 
 		 958 aa  250  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  25.19 
 
 		 974 aa  247  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  26.47 
 
 		 979 aa  240  9e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  26.1 
 
 		 1442 aa  226  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  28.06 
 
 		 963 aa  207  5e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  24.28 
 
 		 1005 aa  207  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  32 
 
 		 963 aa  204  5e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  25.36 
 
 		 922 aa  201  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  25.03 
 
 		 948 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  22.47 
 
 		 948 aa  199  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  22.47 
 
 		 961 aa  194  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  22.31 
 
 		 950 aa  188  3e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  23.74 
 
 		 943 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  32.59 
 
 		 947 aa  187  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  23.81 
 
 		 943 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  31.28 
 
 		 948 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  22.81 
 
 		 943 aa  180  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  23.8 
 
 		 924 aa  178  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  23.21 
 
 		 978 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  22.42 
 
 		 925 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  24.73 
 
 		 918 aa  166  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  22.82 
 
 		 948 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  23.66 
 
 		 913 aa  162  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  21.7 
 
 		 935 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  21.56 
 
 		 934 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  21.51 
 
 		 935 aa  159  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  21.69 
 
 		 935 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  21.99 
 
 		 916 aa  157  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  22.79 
 
 		 924 aa  155  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  29.11 
 
 		 932 aa  151  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  24.07 
 
 		 916 aa  148  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  20.95 
 
 		 940 aa  120  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10319  predicted protein  25.59 
 
 		 1032 aa  113  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195718  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  24.31 
 
 		 439 aa  106  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  20.73 
 
 		 919 aa  97.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1890  M16 family peptidase  28.25 
 
 		 414 aa  95.9  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  29.27 
 
 		 461 aa  94.4  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2179  M16 family peptidase  27.8 
 
 		 414 aa  93.2  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  31.19 
 
 		 937 aa  88.6  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  22.63 
 
 		 948 aa  87.8  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  22.54 
 
 		 878 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52090  predicted protein  27.4 
 
 		 1088 aa  85.9  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0580796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46533  predicted protein  27.4 
 
 		 1088 aa  85.9  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4309  peptidase M16-like  24.3 
 
 		 413 aa  86.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  21.53 
 
 		 957 aa  86.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  28.61 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2341  peptidase M16-like  30.09 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  28.16 
 
 		 476 aa  84.7  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  28.57 
 
 		 464 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  21.07 
 
 		 949 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  21.61 
 
 		 942 aa  81.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  29.3 
 
 		 484 aa  81.3  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  26.13 
 
 		 459 aa  80.9  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  27.24 
 
 		 440 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  28.02 
 
 		 464 aa  80.9  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3889  peptidase M16 domain protein  26.48 
 
 		 491 aa  80.9  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  25.78 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0100  peptidase M16 domain-containing protein  26.45 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4069  M16 family peptidase  26.45 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.187129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  26.98 
 
 		 489 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  27.7 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4063  M16 family peptidase  26.45 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1032  peptidase M16 domain-containing protein  29.33 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.856018  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  27.22 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  20.79 
 
 		 918 aa  78.2  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  28.44 
 
 		 427 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2134  zinc metallopeptidase  24.55 
 
 		 968 aa  77.4  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  25.77 
 
 		 489 aa  77  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  28.44 
 
 		 427 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  29.32 
 
 		 463 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  26.02 
 
 		 461 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  28.37 
 
 		 484 aa  77.8  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  24.82 
 
 		 853 aa  76.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  21.74 
 
 		 943 aa  77  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  25.93 
 
 		 868 aa  77  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0154  peptidase M16 domain-containing protein  23.93 
 
 		 497 aa  76.3  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.389358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>