More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0761 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
924 aa  1904    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  54.11 
 
 
913 aa  974    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  88.01 
 
 
925 aa  1677    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  31.06 
 
 
940 aa  442  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  25.53 
 
 
927 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  23.61 
 
 
936 aa  203  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  23.78 
 
 
955 aa  201  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  23.45 
 
 
927 aa  198  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  23.45 
 
 
927 aa  197  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  23.45 
 
 
927 aa  197  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  23.64 
 
 
927 aa  196  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224289 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  23.24 
 
 
931 aa  194  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  23.24 
 
 
931 aa  194  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  23.24 
 
 
927 aa  193  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  23.24 
 
 
927 aa  193  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  23.24 
 
 
926 aa  193  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  22.86 
 
 
937 aa  172  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  23.9 
 
 
928 aa  165  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  22.69 
 
 
912 aa  160  9e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  23.97 
 
 
938 aa  160  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  24.55 
 
 
912 aa  156  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  21.91 
 
 
932 aa  157  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  21.17 
 
 
941 aa  156  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  22.79 
 
 
938 aa  155  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  21.37 
 
 
933 aa  147  7.0000000000000006e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  21.88 
 
 
954 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  22.9 
 
 
1442 aa  136  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  23.06 
 
 
915 aa  134  5e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  22.17 
 
 
922 aa  132  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  32.08 
 
 
979 aa  130  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  34.68 
 
 
963 aa  125  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  32.31 
 
 
932 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  32.14 
 
 
974 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  29.69 
 
 
948 aa  119  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  26.55 
 
 
947 aa  118  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  24.25 
 
 
935 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  32.38 
 
 
934 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 
958 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52090  predicted protein  23.99 
 
 
1088 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0580796  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46533  predicted protein  23.99 
 
 
1088 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  32.06 
 
 
935 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  24.18 
 
 
950 aa  116  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  32.06 
 
 
935 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  31.9 
 
 
948 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  21.55 
 
 
992 aa  114  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  28.35 
 
 
943 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  24.88 
 
 
948 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  28.63 
 
 
918 aa  113  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  30.63 
 
 
916 aa  112  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  31.1 
 
 
943 aa  110  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  22.53 
 
 
963 aa  109  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  30.62 
 
 
924 aa  108  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  32.71 
 
 
937 aa  108  6e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  32.86 
 
 
1005 aa  108  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  25.34 
 
 
978 aa  105  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  29.3 
 
 
943 aa  104  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  24.59 
 
 
929 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  24.59 
 
 
949 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  24.7 
 
 
431 aa  103  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  25.21 
 
 
453 aa  101  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  24.72 
 
 
947 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  31.73 
 
 
948 aa  98.6  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  28.57 
 
 
465 aa  98.2  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  25.81 
 
 
912 aa  97.8  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  25.29 
 
 
427 aa  97.4  9e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  23.18 
 
 
957 aa  97.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  31.74 
 
 
464 aa  96.3  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  21.49 
 
 
948 aa  96.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  23.47 
 
 
921 aa  95.9  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2922  peptidase M16 domain protein  28.3 
 
 
903 aa  95.1  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.179553  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  25.26 
 
 
928 aa  95.1  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  28.15 
 
 
499 aa  95.5  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  26.69 
 
 
868 aa  94.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  30.99 
 
 
463 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  29.68 
 
 
458 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  29.68 
 
 
458 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  29.68 
 
 
458 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0119  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase)  25.21 
 
 
413 aa  91.7  5e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.369766  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.65 
 
 
452 aa  92  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10319  predicted protein  29.55 
 
 
1032 aa  91.7  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195718  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1890  M16 family peptidase  21.86 
 
 
414 aa  91.7  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  28.68 
 
 
501 aa  90.9  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  28.1 
 
 
878 aa  91.3  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2179  M16 family peptidase  21.86 
 
 
414 aa  90.5  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  28.82 
 
 
921 aa  90.1  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  28.57 
 
 
942 aa  89.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  29.44 
 
 
961 aa  89.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  26.13 
 
 
434 aa  90.1  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  30.74 
 
 
461 aa  90.1  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  24.72 
 
 
949 aa  90.1  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  30.29 
 
 
459 aa  89.4  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  25.86 
 
 
464 aa  89.4  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  21.48 
 
 
896 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  24.18 
 
 
439 aa  88.6  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  28.51 
 
 
453 aa  89  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  28.44 
 
 
949 aa  89  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  27.84 
 
 
912 aa  89  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  28.76 
 
 
879 aa  88.2  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  26.12 
 
 
419 aa  87.8  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  27.61 
 
 
440 aa  87.8  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>