More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4913 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  42.42 
 
 
938 aa  786    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  47.38 
 
 
954 aa  894    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  42.15 
 
 
937 aa  715    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  56.68 
 
 
955 aa  1085    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
936 aa  1911    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  37.01 
 
 
928 aa  583  1.0000000000000001e-165  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  33.93 
 
 
941 aa  519  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  35.59 
 
 
932 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  30.17 
 
 
938 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  29.44 
 
 
912 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  26.67 
 
 
992 aa  340  5e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  28.88 
 
 
912 aa  329  1.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  27.06 
 
 
927 aa  326  1e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  28.14 
 
 
933 aa  324  4e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  26.63 
 
 
1442 aa  303  1e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  25.67 
 
 
958 aa  293  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  26.32 
 
 
963 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  26.83 
 
 
915 aa  279  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  25.67 
 
 
927 aa  271  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  25.56 
 
 
927 aa  270  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  26.92 
 
 
974 aa  269  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  25.56 
 
 
927 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  25.77 
 
 
927 aa  268  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  27.16 
 
 
979 aa  268  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  25.67 
 
 
931 aa  266  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  25.56 
 
 
927 aa  266  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  25.59 
 
 
926 aa  266  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  25.67 
 
 
931 aa  266  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  25.77 
 
 
927 aa  266  2e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  26.18 
 
 
947 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  24.95 
 
 
948 aa  257  6e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  25.27 
 
 
948 aa  251  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  24.95 
 
 
935 aa  241  5e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  24.66 
 
 
934 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  25.46 
 
 
1005 aa  241  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  24.42 
 
 
935 aa  240  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  24.44 
 
 
935 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  24.79 
 
 
948 aa  238  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  25 
 
 
922 aa  237  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  24.04 
 
 
943 aa  233  9e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  24.39 
 
 
963 aa  229  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  24.42 
 
 
948 aa  227  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  24.08 
 
 
950 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  24.19 
 
 
943 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  26.18 
 
 
918 aa  221  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  23.59 
 
 
924 aa  218  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  23.66 
 
 
932 aa  213  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  23.34 
 
 
943 aa  211  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  22.84 
 
 
913 aa  205  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  23.61 
 
 
924 aa  203  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  23.93 
 
 
916 aa  200  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  22.02 
 
 
916 aa  196  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  23.02 
 
 
925 aa  195  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  21.13 
 
 
978 aa  189  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  22.13 
 
 
961 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  21.62 
 
 
940 aa  143  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52090  predicted protein  23.11 
 
 
1088 aa  142  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0580796  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46533  predicted protein  23.11 
 
 
1088 aa  142  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10319  predicted protein  21.2 
 
 
1032 aa  138  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195718  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  24.59 
 
 
868 aa  111  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  26.61 
 
 
443 aa  110  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  26.4 
 
 
443 aa  110  1e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  26.61 
 
 
443 aa  110  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  34.72 
 
 
937 aa  109  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  22.28 
 
 
945 aa  108  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  29.14 
 
 
464 aa  107  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  28.93 
 
 
464 aa  106  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  26.45 
 
 
443 aa  105  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  25.47 
 
 
442 aa  105  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  28.41 
 
 
489 aa  105  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  25.75 
 
 
447 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  26.32 
 
 
443 aa  103  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  29.53 
 
 
461 aa  101  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  26.84 
 
 
461 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  24.02 
 
 
461 aa  100  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  25.1 
 
 
499 aa  99  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  26.36 
 
 
443 aa  98.2  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  23.03 
 
 
879 aa  97.8  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  26.36 
 
 
443 aa  97.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  26.36 
 
 
443 aa  97.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  31.6 
 
 
878 aa  97.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  24.43 
 
 
441 aa  96.3  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  27.11 
 
 
476 aa  95.9  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  25.45 
 
 
484 aa  95.5  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  25.63 
 
 
484 aa  95.5  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  29.18 
 
 
463 aa  95.9  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  25.94 
 
 
443 aa  94.4  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  30.8 
 
 
415 aa  93.6  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  24.64 
 
 
443 aa  94  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  27.92 
 
 
440 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  23.33 
 
 
513 aa  92.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  25.62 
 
 
439 aa  92.4  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4077  peptidase M16 domain protein  24.88 
 
 
485 aa  92.4  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1890  M16 family peptidase  30.28 
 
 
414 aa  92.4  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  24.22 
 
 
484 aa  92.4  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2179  M16 family peptidase  29.81 
 
 
414 aa  91.7  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  24.66 
 
 
443 aa  90.9  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  24.79 
 
 
506 aa  90.5  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2732  peptidase M16 domain protein  29.86 
 
 
408 aa  90.5  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152899  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  28.63 
 
 
459 aa  90.5  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>