More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1950 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  43.17 
 
 
974 aa  738    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  84.7 
 
 
947 aa  1595    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
948 aa  1929    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  35.81 
 
 
963 aa  523  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  35.46 
 
 
948 aa  508  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  32.28 
 
 
979 aa  442  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  30.79 
 
 
1442 aa  442  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  31.32 
 
 
934 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  32.75 
 
 
948 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  31.1 
 
 
935 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  31.43 
 
 
935 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  31.58 
 
 
935 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  30.99 
 
 
943 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  30.85 
 
 
948 aa  412  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  30.45 
 
 
924 aa  412  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  30.14 
 
 
943 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  29.94 
 
 
943 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  31.56 
 
 
978 aa  403  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  30.09 
 
 
961 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  28.68 
 
 
958 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  29.28 
 
 
932 aa  337  5.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  28 
 
 
963 aa  289  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  27.63 
 
 
1005 aa  275  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  24.71 
 
 
955 aa  271  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  25.4 
 
 
950 aa  258  3e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  25.11 
 
 
936 aa  258  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  25.89 
 
 
937 aa  254  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  24.72 
 
 
954 aa  249  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  25.4 
 
 
928 aa  208  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  23.51 
 
 
938 aa  207  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  22.66 
 
 
938 aa  205  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  24.51 
 
 
941 aa  200  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  25.34 
 
 
932 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  23.42 
 
 
912 aa  179  3e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  21.84 
 
 
912 aa  177  8e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  27.46 
 
 
927 aa  176  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  23.07 
 
 
915 aa  172  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  22.02 
 
 
933 aa  157  1e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  23.32 
 
 
922 aa  153  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  24.14 
 
 
927 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  24.11 
 
 
927 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  23.8 
 
 
927 aa  149  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  24.11 
 
 
927 aa  149  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  23.82 
 
 
931 aa  148  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  23.82 
 
 
931 aa  148  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  23.8 
 
 
926 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  23.97 
 
 
927 aa  145  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10319  predicted protein  23.2 
 
 
1032 aa  145  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  24.07 
 
 
927 aa  145  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46533  predicted protein  23.17 
 
 
1088 aa  140  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52090  predicted protein  23.17 
 
 
1088 aa  140  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0580796  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  21.64 
 
 
992 aa  136  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  29.49 
 
 
916 aa  127  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  30.4 
 
 
918 aa  124  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2922  peptidase M16 domain protein  24.06 
 
 
903 aa  120  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.179553  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  22.5 
 
 
879 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  25.88 
 
 
913 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  24.88 
 
 
924 aa  115  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  24.75 
 
 
916 aa  111  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  29.22 
 
 
940 aa  108  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  23.86 
 
 
925 aa  107  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  27.92 
 
 
530 aa  103  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  29.69 
 
 
453 aa  102  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3924  peptidase M16 domain-containing protein  24.19 
 
 
497 aa  101  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  32.03 
 
 
878 aa  101  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0236  peptidase M16 domain protein  33.19 
 
 
937 aa  100  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0946575 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  31.84 
 
 
489 aa  99.4  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3808  protein YhjJ  23.4 
 
 
495 aa  97.8  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  29.45 
 
 
470 aa  97.4  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  30.67 
 
 
868 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3885  hypothetical protein  23.79 
 
 
495 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3989  hypothetical protein  23.54 
 
 
481 aa  96.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.801432  normal  0.0802476 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3929  hypothetical protein  23.79 
 
 
495 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0881778  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3821  protein YhjJ  23.79 
 
 
495 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  31.05 
 
 
454 aa  95.5  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4069  M16 family peptidase  24 
 
 
499 aa  94.7  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.187129 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0100  peptidase M16 domain-containing protein  24 
 
 
499 aa  94.7  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4063  M16 family peptidase  24 
 
 
499 aa  94.7  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  32.68 
 
 
427 aa  94.7  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  31.12 
 
 
506 aa  94  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  29.6 
 
 
493 aa  94  1e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  32.44 
 
 
465 aa  93.2  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  31.13 
 
 
455 aa  92.8  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  28.04 
 
 
945 aa  92  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  29.43 
 
 
428 aa  92.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03375  predicted zinc-dependent peptidase  22.61 
 
 
498 aa  92  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0186  peptidase M16 domain protein  22.61 
 
 
498 aa  92  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03328  hypothetical protein  22.61 
 
 
498 aa  92  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0190  peptidase M16 domain-containing protein  22.61 
 
 
498 aa  92  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3730  M16 family peptidase  22.61 
 
 
498 aa  92  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  33.77 
 
 
451 aa  90.9  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  23.12 
 
 
439 aa  90.5  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  29.97 
 
 
470 aa  90.9  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  28.53 
 
 
853 aa  90.5  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  34.78 
 
 
466 aa  89.7  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4891  peptidase, M16 (pitrilysin) family  22.39 
 
 
498 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271502  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6664  peptidase M16 domain protein  29.08 
 
 
452 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4015  M16 family peptidase  22.39 
 
 
498 aa  90.1  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3835  M16 family peptidase  22.17 
 
 
498 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.173464 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3933  peptidase, M16 (pitrilysin) family  22.39 
 
 
498 aa  89.4  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>