240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_4063 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0154  peptidase M16 domain-containing protein  72 
 
 
497 aa  761    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.389358 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0100  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
499 aa  1018    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4069  M16 family peptidase  100 
 
 
499 aa  1018    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.187129 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4063  M16 family peptidase  100 
 
 
499 aa  1018    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4077  peptidase M16 domain protein  64.27 
 
 
485 aa  640    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3924  peptidase M16 domain-containing protein  65.82 
 
 
497 aa  673    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3889  peptidase M16 domain protein  64.3 
 
 
491 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03375  predicted zinc-dependent peptidase  62.24 
 
 
498 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0186  peptidase M16 domain protein  62.24 
 
 
498 aa  630  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3821  protein YhjJ  61.38 
 
 
495 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03328  hypothetical protein  62.24 
 
 
498 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0190  peptidase M16 domain-containing protein  62.24 
 
 
498 aa  630  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3885  hypothetical protein  61.38 
 
 
495 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3730  M16 family peptidase  62.24 
 
 
498 aa  630  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4891  peptidase, M16 (pitrilysin) family  62.24 
 
 
498 aa  629  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271502  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0084  peptidase M16 domain protein  64.69 
 
 
505 aa  630  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3929  hypothetical protein  61.38 
 
 
495 aa  628  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0881778  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4015  M16 family peptidase  62.08 
 
 
498 aa  624  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3808  protein YhjJ  60.97 
 
 
495 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3835  M16 family peptidase  62.08 
 
 
498 aa  624  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.173464 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3933  peptidase, M16 (pitrilysin) family  61.86 
 
 
498 aa  623  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0081  peptidase M16 domain protein  64.63 
 
 
500 aa  616  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3989  hypothetical protein  60.88 
 
 
481 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.801432  normal  0.0802476 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  25.54 
 
 
922 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  23.91 
 
 
916 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  31.38 
 
 
958 aa  111  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  30.79 
 
 
979 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  24.01 
 
 
948 aa  91.3  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  27.42 
 
 
928 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  22.69 
 
 
927 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  28.75 
 
 
932 aa  89  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  22.45 
 
 
927 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  24.1 
 
 
933 aa  88.2  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  24.67 
 
 
918 aa  88.6  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  21.02 
 
 
936 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  22.69 
 
 
927 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  22.45 
 
 
927 aa  87  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  22.45 
 
 
931 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  22.45 
 
 
931 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  24.28 
 
 
927 aa  86.3  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  22.33 
 
 
926 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  22.45 
 
 
927 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  24.18 
 
 
947 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  26.02 
 
 
932 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  28.64 
 
 
963 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0410  N- methylation  23.84 
 
 
912 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  24.73 
 
 
955 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  22.22 
 
 
927 aa  84  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  25.35 
 
 
963 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  27.95 
 
 
924 aa  81.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  22.9 
 
 
941 aa  80.5  0.00000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  24.36 
 
 
974 aa  80.5  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  26.45 
 
 
938 aa  79.3  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  27.8 
 
 
1005 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  24.64 
 
 
924 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  22.96 
 
 
916 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  25.42 
 
 
954 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  21.79 
 
 
992 aa  77.4  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  24.8 
 
 
943 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  23.21 
 
 
950 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  28.57 
 
 
943 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  25.4 
 
 
937 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  28.57 
 
 
913 aa  73.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  22.24 
 
 
912 aa  73.6  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  26.38 
 
 
948 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  25.38 
 
 
925 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  23.97 
 
 
948 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  21.23 
 
 
915 aa  70.5  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  24.56 
 
 
978 aa  70.5  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  21.39 
 
 
940 aa  69.7  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  24.22 
 
 
938 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  24.22 
 
 
1442 aa  67.4  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  23.26 
 
 
439 aa  65.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  28.5 
 
 
493 aa  64.7  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  24.1 
 
 
943 aa  63.9  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  26.84 
 
 
530 aa  63.9  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  28.5 
 
 
489 aa  63.5  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  28.84 
 
 
948 aa  63.2  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  23.85 
 
 
935 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  25.99 
 
 
918 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  22.99 
 
 
453 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  24.69 
 
 
935 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  23.4 
 
 
464 aa  61.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  23.75 
 
 
935 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  24.89 
 
 
919 aa  61.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  25.1 
 
 
961 aa  60.5  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  24.56 
 
 
948 aa  60.5  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  24.69 
 
 
934 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4194  peptidase M16 domain protein  22.84 
 
 
424 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4233  peptidase M16 domain protein  22.84 
 
 
424 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00835158 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  25.44 
 
 
868 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  24.66 
 
 
921 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  22.83 
 
 
921 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  23.05 
 
 
879 aa  58.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  25.91 
 
 
945 aa  58.2  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  23.77 
 
 
476 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  27.65 
 
 
414 aa  57.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  24.41 
 
 
464 aa  57.4  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  25.59 
 
 
949 aa  57  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  22.32 
 
 
470 aa  56.6  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>