More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3262 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3262  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
948 aa  1944    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.55442  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4022  M16 family peptidase  80.38 
 
 
943 aa  1560    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3743  peptidase M16 domain-containing protein  89.4 
 
 
934 aa  1689    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.358809  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0644  peptidase M16 domain protein  89.2 
 
 
935 aa  1691    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.273767  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0621  peptidase M16 domain-containing protein  88.88 
 
 
935 aa  1686    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0648  peptidase M16 domain-containing protein  89.95 
 
 
935 aa  1704    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3417  peptidase M16 domain-containing protein  78.55 
 
 
924 aa  1513    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0535  peptidase M16 domain-containing protein  77.73 
 
 
943 aa  1524    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3588  peptidase M16 domain-containing protein  78.68 
 
 
943 aa  1530    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0585  peptidase M16-like protein  34.87 
 
 
963 aa  512  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201942  normal  0.922639 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2605  peptidase M16 domain-containing protein  33.7 
 
 
948 aa  493  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.112505  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1038  peptidase M16-like  33.52 
 
 
948 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3734  peptidase M16 domain-containing protein  31.76 
 
 
974 aa  409  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.13373  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1775  peptidase M16 domain protein  30.81 
 
 
947 aa  403  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0818979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1950  peptidase M16 domain protein  30.83 
 
 
948 aa  399  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0576  peptidase M16 domain protein  27.88 
 
 
1442 aa  393  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2530  peptidase M16 domain-containing protein  29.14 
 
 
979 aa  358  2.9999999999999997e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.820907  normal  0.0332492 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0977  peptidase M16 domain-containing protein  28.21 
 
 
932 aa  325  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1400  peptidase M16 domain-containing protein  27.02 
 
 
958 aa  321  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0990  peptidase M16-like  26.19 
 
 
961 aa  297  6e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0444  M16 family peptidase putative  27.75 
 
 
963 aa  265  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1966  peptidase M16-like protein  23.87 
 
 
978 aa  233  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0850  peptidase M16 domain-containing protein  24.83 
 
 
1005 aa  229  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0487817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4913  peptidase M16 domain protein  24.56 
 
 
936 aa  227  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.925489  normal  0.100399 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1223  peptidase M16 domain protein  23.1 
 
 
950 aa  224  8e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.445793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5397  peptidase M16 domain protein  24.59 
 
 
955 aa  191  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0196  M16 family peptidase  22.33 
 
 
941 aa  187  7e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4144  peptidase M16 domain protein  22.86 
 
 
954 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.324827 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1679  M16B family peptidase  23.18 
 
 
927 aa  179  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3055  peptidase M16 domain protein  24.08 
 
 
937 aa  179  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1758  peptidase, M16B family  22.96 
 
 
927 aa  179  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0324613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2163  peptidase M16 domain-containing protein  22.81 
 
 
927 aa  179  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.618629  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0384  peptidase M16 domain protein  25.19 
 
 
928 aa  178  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2107  peptidase, M16B family  23.07 
 
 
927 aa  178  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.224289 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1684  M16B family peptidase  22.96 
 
 
927 aa  177  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01452  predicted peptidase  22.96 
 
 
931 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01465  hypothetical protein  22.96 
 
 
931 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1579  M16B family peptidase  22.96 
 
 
926 aa  174  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.90671  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2152  peptidase M16 domain protein  22.96 
 
 
927 aa  173  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0104203  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0892  zinc protease  26.09 
 
 
927 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283708  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0056  peptidase M16 domain protein  22.94 
 
 
938 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.456752 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1711  putative zinc protease  22.61 
 
 
915 aa  161  5e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.548584  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0543  putative zinc protease  23.21 
 
 
933 aa  159  3e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0301217  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001074  zinc protease insulinase family  33.1 
 
 
916 aa  158  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1312  zinc protease  22.83 
 
 
922 aa  154  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.792091  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2979  Zn-dependent peptidase  33.06 
 
 
918 aa  149  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3941  peptidase M16 domain-containing protein  21.06 
 
 
938 aa  147  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.868589  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0438  peptidase M16 domain protein  31.92 
 
 
932 aa  140  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04785  zinc protease  34.96 
 
 
916 aa  134  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2215  M16 family peptidase  29.82 
 
 
912 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0761  peptidase M16 domain protein  31.9 
 
 
924 aa  115  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  30.17 
 
 
913 aa  110  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31795  predicted protein  19.6 
 
 
992 aa  109  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.163312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3809  peptidase M16 domain-containing protein  22.26 
 
 
940 aa  107  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0998  peptidase M16 domain protein  29.58 
 
 
925 aa  107  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  26.62 
 
 
439 aa  99  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46533  predicted protein  29.49 
 
 
1088 aa  96.3  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52090  predicted protein  29.49 
 
 
1088 aa  96.3  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0580796  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  27.57 
 
 
489 aa  94.4  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  26.09 
 
 
493 aa  93.6  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  22.7 
 
 
942 aa  91.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10319  predicted protein  29.31 
 
 
1032 aa  90.5  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195718  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  24.35 
 
 
530 aa  90.1  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2368  peptidase M16 domain-containing protein  25.27 
 
 
853 aa  88.6  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.136771 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  22.81 
 
 
868 aa  88.2  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  29.38 
 
 
443 aa  86.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  29.38 
 
 
879 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  31.34 
 
 
440 aa  85.9  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  22.6 
 
 
878 aa  83.2  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  28.57 
 
 
464 aa  83.2  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  27.05 
 
 
464 aa  82.8  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  28.63 
 
 
476 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  26.3 
 
 
470 aa  82  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  26.85 
 
 
459 aa  80.5  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  27.96 
 
 
461 aa  80.9  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  29.71 
 
 
427 aa  80.9  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  30.91 
 
 
433 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  28.44 
 
 
431 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  29.26 
 
 
440 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  27.7 
 
 
419 aa  79  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0767  peptidase M16 domain protein  28.5 
 
 
415 aa  79  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.276188  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  29.49 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  22.86 
 
 
912 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4077  peptidase M16 domain protein  24.58 
 
 
485 aa  77.4  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  28.04 
 
 
419 aa  77.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3889  peptidase M16 domain protein  23.46 
 
 
491 aa  76.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  29.15 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  28.03 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2179  M16 family peptidase  22.27 
 
 
414 aa  76.3  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0524526  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  28.89 
 
 
489 aa  75.5  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  28.1 
 
 
453 aa  75.5  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  28.57 
 
 
455 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  25.21 
 
 
448 aa  75.1  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  25.21 
 
 
448 aa  75.1  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1890  M16 family peptidase  22.27 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  21.5 
 
 
918 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  24.87 
 
 
513 aa  74.7  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  25.91 
 
 
453 aa  73.9  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  24.71 
 
 
896 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  28.91 
 
 
461 aa  73.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>