More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5165 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  74.13 
 
 		 433 aa  647    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  74.36 
 
 		 433 aa  650    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 433 aa  883    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  44.2 
 
 		 447 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  41.59 
 
 		 455 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  42.16 
 
 		 448 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  40.66 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  40.24 
 
 		 450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  39.52 
 
 		 450 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  40.49 
 
 		 465 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  40.49 
 
 		 465 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  38.95 
 
 		 451 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  38.24 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  37.77 
 
 		 451 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  38 
 
 		 451 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  36.93 
 
 		 466 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  35.58 
 
 		 493 aa  256  7e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  34.86 
 
 		 489 aa  253  7e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  33.58 
 
 		 441 aa  252  9.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  33.58 
 
 		 441 aa  252  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  34.76 
 
 		 470 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  36.17 
 
 		 459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  32.86 
 
 		 442 aa  242  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  33.25 
 
 		 530 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  32.62 
 
 		 459 aa  240  4e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  33.74 
 
 		 453 aa  239  9e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  31.95 
 
 		 455 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  32.24 
 
 		 453 aa  230  3e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  33.17 
 
 		 470 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  32.37 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  31.27 
 
 		 454 aa  223  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  33.57 
 
 		 465 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  34.12 
 
 		 462 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  32.68 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  31.28 
 
 		 504 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  31.13 
 
 		 506 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  34.06 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  31.5 
 
 		 452 aa  210  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  30.88 
 
 		 494 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  31.2 
 
 		 501 aa  206  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  30.39 
 
 		 477 aa  205  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  31.26 
 
 		 464 aa  202  7e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  32.47 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  32 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  31.53 
 
 		 477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  33.09 
 
 		 443 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  32.78 
 
 		 463 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  29.08 
 
 		 513 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  29.65 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  29.65 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  31.1 
 
 		 476 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  31.88 
 
 		 464 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  30.14 
 
 		 448 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  31.77 
 
 		 493 aa  192  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  28.03 
 
 		 514 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  31.66 
 
 		 499 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  30.16 
 
 		 459 aa  190  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  30.68 
 
 		 459 aa  189  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  30.17 
 
 		 456 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  31.98 
 
 		 459 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  32.62 
 
 		 489 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  31.34 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  29.95 
 
 		 492 aa  184  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  30.44 
 
 		 460 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  30.94 
 
 		 472 aa  183  5.0000000000000004e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  30.83 
 
 		 479 aa  182  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  30.96 
 
 		 457 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  30.05 
 
 		 454 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  30.16 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  30.02 
 
 		 460 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  30.02 
 
 		 460 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  29.98 
 
 		 468 aa  178  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  29.7 
 
 		 463 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  29.78 
 
 		 460 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  29.58 
 
 		 443 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  29.13 
 
 		 484 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  31.43 
 
 		 509 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  29.27 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0849  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  26.94 
 
 		 438 aa  167  4e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.745956  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  30.97 
 
 		 481 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  28.57 
 
 		 484 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  26.53 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  28.08 
 
 		 484 aa  160  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  31.22 
 
 		 458 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  27.42 
 
 		 443 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  29.28 
 
 		 473 aa  159  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  28.34 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  30.48 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  27.63 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  27.63 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  29.84 
 
 		 943 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  30.48 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  27.66 
 
 		 443 aa  157  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1057  M16 family peptidase  26.63 
 
 		 439 aa  157  4e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  27.06 
 
 		 443 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  27.32 
 
 		 443 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  26.18 
 
 		 442 aa  156  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  27.59 
 
 		 443 aa  156  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  27.63 
 
 		 443 aa  156  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  27.08 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>