More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4752 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  84.19 
 
 
451 aa  767    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  97.33 
 
 
450 aa  894    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  100 
 
 
450 aa  919    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  85.23 
 
 
451 aa  804    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  74.5 
 
 
455 aa  678    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  74.72 
 
 
465 aa  687    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  84.63 
 
 
451 aa  771    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  83.74 
 
 
451 aa  763    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  84.41 
 
 
451 aa  771    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  76.91 
 
 
448 aa  693    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  74.72 
 
 
465 aa  687    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  49.28 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  49.04 
 
 
441 aa  415  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  48.57 
 
 
453 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  49.88 
 
 
466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  44.47 
 
 
459 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  46.59 
 
 
470 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  48.2 
 
 
459 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  46.08 
 
 
453 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  43.31 
 
 
465 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  42.65 
 
 
442 aa  362  7.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  41.47 
 
 
459 aa  362  7.0000000000000005e-99  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  41.55 
 
 
452 aa  360  3e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  42.69 
 
 
493 aa  359  4e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  42.23 
 
 
530 aa  358  9e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  42.79 
 
 
489 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  46.79 
 
 
443 aa  353  2e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  41.5 
 
 
506 aa  352  7e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  42.21 
 
 
504 aa  349  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  41.59 
 
 
454 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  40 
 
 
477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  42.83 
 
 
460 aa  339  5e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  41 
 
 
501 aa  339  7e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  40.89 
 
 
455 aa  338  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  45.3 
 
 
462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  39.53 
 
 
494 aa  336  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  43.5 
 
 
470 aa  335  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  41.81 
 
 
492 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  41.09 
 
 
484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  41.33 
 
 
484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  40.24 
 
 
433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  40.28 
 
 
484 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  38.58 
 
 
453 aa  300  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  39.3 
 
 
447 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  38.92 
 
 
433 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  41.09 
 
 
479 aa  293  6e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  38.92 
 
 
433 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  37.8 
 
 
499 aa  290  4e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  38.89 
 
 
493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  37.89 
 
 
459 aa  272  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  40.05 
 
 
473 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  37.99 
 
 
481 aa  263  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  36.55 
 
 
463 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  37.67 
 
 
509 aa  260  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  35.98 
 
 
469 aa  259  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  36.55 
 
 
489 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  35.99 
 
 
476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  36.7 
 
 
461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  34.76 
 
 
513 aa  253  5.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  36.68 
 
 
461 aa  252  9.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  36.45 
 
 
472 aa  252  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  36.98 
 
 
464 aa  251  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  34.44 
 
 
514 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  36.75 
 
 
464 aa  251  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  36 
 
 
456 aa  249  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  35.14 
 
 
448 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  35.14 
 
 
448 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  36.18 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  36.27 
 
 
457 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  35.16 
 
 
448 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  36.12 
 
 
428 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  35.53 
 
 
477 aa  235  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  33.72 
 
 
468 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  36.36 
 
 
459 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  34.15 
 
 
463 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  36.3 
 
 
469 aa  231  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  34.38 
 
 
441 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  34.77 
 
 
457 aa  226  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  37.97 
 
 
460 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  37.97 
 
 
460 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  36.1 
 
 
460 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  34.13 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  35.38 
 
 
454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  33.89 
 
 
457 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  32.13 
 
 
443 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  32.78 
 
 
458 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  32.78 
 
 
458 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  32.78 
 
 
458 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  31.69 
 
 
944 aa  213  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  33.25 
 
 
467 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  30.96 
 
 
453 aa  209  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  34.43 
 
 
439 aa  209  9e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  34.47 
 
 
876 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  31.44 
 
 
944 aa  208  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  30.77 
 
 
943 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  31.38 
 
 
443 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  31.45 
 
 
441 aa  207  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  31.53 
 
 
949 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  30.23 
 
 
442 aa  206  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  31.53 
 
 
949 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>