More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3228 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
493 aa  1010    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  44.17 
 
 
453 aa  365  1e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  44.63 
 
 
470 aa  344  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  40.36 
 
 
452 aa  343  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  42.32 
 
 
465 aa  340  2e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  42.62 
 
 
459 aa  327  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  38.75 
 
 
454 aa  325  9e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  39.06 
 
 
494 aa  325  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  39.43 
 
 
459 aa  323  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  39.23 
 
 
477 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  39.66 
 
 
506 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  38.43 
 
 
455 aa  322  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  39.72 
 
 
504 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  38.46 
 
 
501 aa  318  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  42.35 
 
 
466 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  38.86 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  41.26 
 
 
470 aa  315  9.999999999999999e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  39.76 
 
 
442 aa  314  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  38.63 
 
 
441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  39.52 
 
 
459 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  39.81 
 
 
453 aa  311  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  40.61 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  39.18 
 
 
465 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  39.18 
 
 
465 aa  296  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  40.42 
 
 
451 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  39.66 
 
 
484 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  39.72 
 
 
451 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  39.49 
 
 
451 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  39.49 
 
 
451 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  36.64 
 
 
876 aa  288  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  39.37 
 
 
448 aa  285  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  39.06 
 
 
492 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  38.89 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  38.41 
 
 
450 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  37.28 
 
 
457 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  40.38 
 
 
484 aa  280  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  40.38 
 
 
484 aa  279  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  38.46 
 
 
451 aa  276  7e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  39 
 
 
443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  38.46 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  37.83 
 
 
422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  36.79 
 
 
441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  37.61 
 
 
455 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  35.44 
 
 
447 aa  274  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  35.85 
 
 
443 aa  273  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  40.52 
 
 
479 aa  273  7e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  36.54 
 
 
457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  36.79 
 
 
428 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  34.43 
 
 
431 aa  267  4e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  37.02 
 
 
424 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  36 
 
 
469 aa  266  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  37.94 
 
 
459 aa  266  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  34.62 
 
 
493 aa  266  7e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  37.27 
 
 
499 aa  265  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  36.15 
 
 
514 aa  263  6.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  35.01 
 
 
489 aa  262  1e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  39.23 
 
 
509 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  35.12 
 
 
513 aa  259  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  35.29 
 
 
461 aa  256  8e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  35.75 
 
 
457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  33.49 
 
 
442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  35.17 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  33.41 
 
 
443 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 
530 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  35.51 
 
 
464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  33.33 
 
 
494 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  35.61 
 
 
476 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  34.17 
 
 
441 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  37.62 
 
 
467 aa  253  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  33.33 
 
 
494 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  33.18 
 
 
443 aa  252  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  36.45 
 
 
456 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  35.49 
 
 
464 aa  252  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  39.04 
 
 
477 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  35.71 
 
 
468 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  32.05 
 
 
461 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  35.7 
 
 
461 aa  250  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  36.41 
 
 
439 aa  248  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  40.19 
 
 
473 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  34.43 
 
 
448 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  34.43 
 
 
448 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2530  peptidase M16-like  32.73 
 
 
496 aa  246  8e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  32.28 
 
 
443 aa  246  8e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  35.29 
 
 
448 aa  246  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  31.83 
 
 
443 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  34.14 
 
 
489 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  31.75 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  31.6 
 
 
443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  31.83 
 
 
443 aa  243  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  31.63 
 
 
526 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  35.9 
 
 
469 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  31.83 
 
 
443 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3215  peptidase M16 domain-containing protein  32.98 
 
 
510 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  31.38 
 
 
443 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  31.45 
 
 
443 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  31.42 
 
 
520 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  31.45 
 
 
443 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  32.76 
 
 
468 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  31.45 
 
 
443 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  34.36 
 
 
453 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>