More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1279 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  100 
 
 
481 aa  971    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  78.15 
 
 
499 aa  750    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  72.1 
 
 
509 aa  622  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  64.74 
 
 
492 aa  589  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  66.88 
 
 
473 aa  584  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  62.13 
 
 
484 aa  581  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  67.83 
 
 
484 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  68.56 
 
 
484 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  67.9 
 
 
479 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  50.56 
 
 
477 aa  445  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  51.67 
 
 
501 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  51.85 
 
 
494 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  50.76 
 
 
506 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  47.65 
 
 
504 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  48.33 
 
 
455 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  49.89 
 
 
452 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  51.74 
 
 
470 aa  428  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  46.78 
 
 
454 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  46.58 
 
 
470 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  46.09 
 
 
453 aa  395  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  46.6 
 
 
465 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  46.03 
 
 
466 aa  356  5e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  40.13 
 
 
459 aa  341  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  40.14 
 
 
441 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  40.14 
 
 
441 aa  325  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  41.55 
 
 
453 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  41.86 
 
 
459 aa  316  6e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  41.12 
 
 
462 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  40.75 
 
 
448 aa  299  8e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  40.47 
 
 
451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  38.3 
 
 
451 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  38.99 
 
 
465 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  38.99 
 
 
465 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  36.21 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  37.99 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  34.97 
 
 
459 aa  284  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  40 
 
 
451 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  39.76 
 
 
451 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  37.99 
 
 
450 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  39.53 
 
 
451 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  39.18 
 
 
455 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  40.72 
 
 
460 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  40.52 
 
 
443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  36.01 
 
 
513 aa  270  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  36.36 
 
 
514 aa  267  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  38.36 
 
 
463 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  35.66 
 
 
493 aa  264  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  38.01 
 
 
476 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  40.09 
 
 
477 aa  262  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  35.45 
 
 
489 aa  260  4e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  38.78 
 
 
469 aa  257  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  37.36 
 
 
461 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  38.25 
 
 
456 aa  254  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  37.7 
 
 
464 aa  254  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  38.41 
 
 
489 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  36.52 
 
 
461 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  35.21 
 
 
453 aa  252  1e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  35.94 
 
 
493 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  38.43 
 
 
459 aa  250  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  37.02 
 
 
464 aa  249  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  38.91 
 
 
448 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  38.91 
 
 
448 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  38.04 
 
 
468 aa  245  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  37.86 
 
 
457 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  38.35 
 
 
459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  38.11 
 
 
454 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  37.73 
 
 
472 aa  238  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  38.31 
 
 
460 aa  238  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  37.62 
 
 
459 aa  237  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  35.73 
 
 
467 aa  238  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  38.31 
 
 
460 aa  238  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  37.08 
 
 
448 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  38.14 
 
 
453 aa  236  8e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  38.31 
 
 
460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  31.79 
 
 
530 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  37.38 
 
 
469 aa  230  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  36.88 
 
 
463 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  33.33 
 
 
453 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  35.57 
 
 
457 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  35.57 
 
 
441 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  35.57 
 
 
457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  33.41 
 
 
441 aa  213  9e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  31.7 
 
 
433 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  30.39 
 
 
447 aa  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  31.3 
 
 
433 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  32.52 
 
 
876 aa  209  9e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  34.04 
 
 
443 aa  208  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  34.62 
 
 
428 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  33.33 
 
 
443 aa  202  8e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  33.57 
 
 
443 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  33.1 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 
442 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  33.1 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  31.9 
 
 
443 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  30.25 
 
 
440 aa  199  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  32.05 
 
 
443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>