More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4178 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  90.2 
 
 
459 aa  835    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  77.95 
 
 
460 aa  712    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  87.42 
 
 
454 aa  801    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  77.95 
 
 
460 aa  712    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  79.77 
 
 
460 aa  720    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
459 aa  929    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  80.86 
 
 
469 aa  726    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  59.67 
 
 
457 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  58.04 
 
 
469 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  56.09 
 
 
468 aa  485  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  55.42 
 
 
464 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  54.89 
 
 
461 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  54.46 
 
 
476 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  54.7 
 
 
489 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  53.37 
 
 
461 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  53.46 
 
 
464 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  52.28 
 
 
463 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  46.19 
 
 
514 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  45.95 
 
 
513 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  50.71 
 
 
448 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  47.28 
 
 
477 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  50.48 
 
 
448 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  50.48 
 
 
448 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  48.06 
 
 
456 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  46.3 
 
 
453 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  47.78 
 
 
459 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  43.97 
 
 
453 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  46.19 
 
 
472 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  41.47 
 
 
467 aa  340  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  43.3 
 
 
463 aa  320  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  38.26 
 
 
453 aa  285  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  36.45 
 
 
441 aa  283  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  36.45 
 
 
441 aa  282  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1057  M16 family peptidase  36.59 
 
 
439 aa  281  1e-74  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  39.6 
 
 
453 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  37.53 
 
 
470 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  35.84 
 
 
506 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0849  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  35.61 
 
 
438 aa  268  2e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.745956  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  39.57 
 
 
466 aa  268  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  36.79 
 
 
453 aa  266  5e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  39.76 
 
 
470 aa  266  8e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  37.8 
 
 
452 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  36.72 
 
 
465 aa  260  4e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  35.6 
 
 
504 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  34.35 
 
 
442 aa  257  3e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  34.12 
 
 
459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  34.24 
 
 
454 aa  253  5.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  33.41 
 
 
493 aa  253  6e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  38.52 
 
 
459 aa  252  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  35.34 
 
 
459 aa  251  2e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  34.82 
 
 
494 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  33.17 
 
 
455 aa  250  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  39.52 
 
 
443 aa  249  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  34.4 
 
 
477 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  40.93 
 
 
509 aa  247  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  39.42 
 
 
462 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  33.73 
 
 
489 aa  246  8e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  38.53 
 
 
499 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  35.73 
 
 
501 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  36.71 
 
 
448 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  38 
 
 
460 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  34.27 
 
 
493 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  37.76 
 
 
484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  36.51 
 
 
492 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  34.75 
 
 
465 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  34.75 
 
 
465 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  34.84 
 
 
450 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  34.06 
 
 
530 aa  228  1e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  34.92 
 
 
451 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  34.68 
 
 
451 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  36.67 
 
 
484 aa  225  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  34.44 
 
 
451 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  34.44 
 
 
451 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  33.82 
 
 
451 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  34.13 
 
 
450 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  36.34 
 
 
484 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0761  insulinase family protease  32.6 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.126087  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  36.61 
 
 
479 aa  220  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  31.26 
 
 
431 aa  219  6e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  34.06 
 
 
455 aa  219  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  31.57 
 
 
447 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  38.18 
 
 
473 aa  219  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0582  M16 family peptidase  31.39 
 
 
414 aa  216  8e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  37.62 
 
 
481 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  33.73 
 
 
457 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  33.25 
 
 
457 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  32.13 
 
 
441 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  33.25 
 
 
441 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0627  peptidase, M16 family  30.22 
 
 
417 aa  207  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  34.07 
 
 
428 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0896  M16 family peptidase  30.54 
 
 
416 aa  206  8e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.121983  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0826  M16 family peptidase  30.54 
 
 
416 aa  206  8e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106023  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  31.24 
 
 
937 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1139  M16 family peptidase  30.9 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1205  M16 family peptidase  29.8 
 
 
416 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.75942  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0119  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase)  30.43 
 
 
413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.369766  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  30.14 
 
 
443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  31.85 
 
 
876 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  29.93 
 
 
442 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0914  M16 family peptidase  32.55 
 
 
437 aa  194  3e-48  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000029029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>