More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0627 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0896  M16 family peptidase  75 
 
 
416 aa  652    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.121983  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0627  peptidase, M16 family  100 
 
 
417 aa  852    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0826  M16 family peptidase  75 
 
 
416 aa  652    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106023  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1205  M16 family peptidase  74.28 
 
 
416 aa  644    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.75942  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1139  M16 family peptidase  65.78 
 
 
413 aa  580  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0119  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase)  66.26 
 
 
413 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.369766  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0785  M16 family peptidase  62.5 
 
 
415 aa  546  1e-154  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0582  M16 family peptidase  59.41 
 
 
414 aa  521  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  60.15 
 
 
431 aa  520  1e-146  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  60.98 
 
 
434 aa  512  1e-144  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  32.53 
 
 
469 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  32.58 
 
 
493 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  31.4 
 
 
476 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  31.96 
 
 
459 aa  222  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  33.09 
 
 
442 aa  219  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  31.33 
 
 
469 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  31.88 
 
 
463 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  31.33 
 
 
454 aa  218  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  30.92 
 
 
461 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  31.31 
 
 
460 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  31.9 
 
 
513 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  31.76 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  30.32 
 
 
477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  30.92 
 
 
460 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  30.88 
 
 
489 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  30.92 
 
 
460 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  32.69 
 
 
457 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  31.34 
 
 
443 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  29.44 
 
 
457 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  31.4 
 
 
443 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  31.4 
 
 
443 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  31.16 
 
 
443 aa  209  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  30.22 
 
 
459 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  31.16 
 
 
443 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  31.16 
 
 
443 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  30.94 
 
 
514 aa  207  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  31.2 
 
 
466 aa  206  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  32.44 
 
 
443 aa  206  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  28.57 
 
 
443 aa  206  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  30.38 
 
 
470 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  31.16 
 
 
443 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  29.2 
 
 
441 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  31.16 
 
 
443 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  31.58 
 
 
468 aa  204  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  31.4 
 
 
443 aa  204  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  32 
 
 
464 aa  203  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  28.95 
 
 
457 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  30.24 
 
 
461 aa  203  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  31.16 
 
 
443 aa  202  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  31.82 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  31.55 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  30.17 
 
 
448 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  30.17 
 
 
448 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  30.75 
 
 
453 aa  199  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  29.38 
 
 
453 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  32.38 
 
 
443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  28.92 
 
 
464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  30.93 
 
 
455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  30.64 
 
 
929 aa  196  6e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  30.68 
 
 
461 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  30.17 
 
 
448 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  29.34 
 
 
414 aa  195  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  30.05 
 
 
453 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  30.19 
 
 
462 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  31.16 
 
 
443 aa  194  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  30.29 
 
 
441 aa  193  5e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  30.29 
 
 
441 aa  193  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  30.15 
 
 
454 aa  193  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  30.88 
 
 
470 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  28.43 
 
 
464 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  31.23 
 
 
447 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  30 
 
 
504 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  30.79 
 
 
463 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  28.85 
 
 
456 aa  189  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  30.12 
 
 
451 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  28.22 
 
 
428 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  28.75 
 
 
465 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  28.75 
 
 
465 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  29.34 
 
 
450 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1986  processing protease  29.98 
 
 
440 aa  187  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.500047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.5 
 
 
506 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  29.43 
 
 
448 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  28.57 
 
 
411 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  28.37 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  28.85 
 
 
450 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  28.75 
 
 
442 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  28.89 
 
 
459 aa  181  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  27.46 
 
 
413 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  29.74 
 
 
494 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  29.25 
 
 
439 aa  180  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  28.99 
 
 
411 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  29.04 
 
 
451 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  28.47 
 
 
530 aa  179  7e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  28.98 
 
 
467 aa  179  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  29.29 
 
 
451 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  27.86 
 
 
470 aa  179  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  29.47 
 
 
477 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  28.19 
 
 
465 aa  179  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  29.85 
 
 
954 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  29.31 
 
 
501 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>