More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1348 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  100 
 
 		 439 aa  888    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  52.96 
 
 		 464 aa  452  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  46.75 
 
 		 929 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  40.58 
 
 		 919 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  41.83 
 
 		 948 aa  301  2e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  42.59 
 
 		 928 aa  299  7e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  38.7 
 
 		 912 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  37.33 
 
 		 934 aa  283  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  38.3 
 
 		 949 aa  282  7.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  36.92 
 
 		 918 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  39.05 
 
 		 942 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  38.59 
 
 		 921 aa  271  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  34.66 
 
 		 912 aa  267  2.9999999999999995e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  39.23 
 
 		 957 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  36.56 
 
 		 876 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  39.95 
 
 		 457 aa  253  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  39.05 
 
 		 428 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  36.41 
 
 		 493 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  38.24 
 
 		 422 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  39.3 
 
 		 441 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  38.96 
 
 		 457 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  37.11 
 
 		 896 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  36.28 
 
 		 470 aa  240  5e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  35.87 
 
 		 903 aa  238  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  36.45 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  35.49 
 
 		 442 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  37.77 
 
 		 424 aa  236  8e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  35.43 
 
 		 504 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  34.47 
 
 		 945 aa  233  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  34.93 
 
 		 452 aa  230  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  33.98 
 
 		 459 aa  229  6e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  35.66 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  34.05 
 
 		 465 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  34.77 
 
 		 443 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  35.25 
 
 		 443 aa  227  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  34.05 
 
 		 443 aa  226  7e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  34.53 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  34.53 
 
 		 443 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  34.84 
 
 		 443 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  33.41 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  35.49 
 
 		 443 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  33.81 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  34.29 
 
 		 443 aa  223  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  35.61 
 
 		 501 aa  223  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  34.39 
 
 		 937 aa  222  8e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  33.18 
 
 		 441 aa  223  8e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  33.81 
 
 		 443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  33.81 
 
 		 443 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  32.08 
 
 		 526 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  33.57 
 
 		 443 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  34.78 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  33.09 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  32.75 
 
 		 494 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  34.05 
 
 		 443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  35.31 
 
 		 466 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  31.87 
 
 		 520 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  34.83 
 
 		 506 aa  216  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  33.33 
 
 		 443 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3215  peptidase M16 domain-containing protein  32.97 
 
 		 510 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  32.07 
 
 		 532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  35.59 
 
 		 463 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  36.21 
 
 		 921 aa  213  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  33.73 
 
 		 494 aa  212  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0496  peptidase M16 domain protein  32.76 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  33.97 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  34.29 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  31.5 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  34.43 
 
 		 450 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  31.67 
 
 		 494 aa  209  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  34.43 
 
 		 450 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  30.83 
 
 		 431 aa  208  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  35.73 
 
 		 462 aa  209  1e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  37.11 
 
 		 459 aa  207  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3629  peptidase M16 domain-containing protein  32.03 
 
 		 497 aa  207  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.854314  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  31.56 
 
 		 528 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0785  M16 family peptidase  30.92 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  34.13 
 
 		 464 aa  206  8e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 		 453 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  33.57 
 
 		 465 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  35.25 
 
 		 489 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  33.57 
 
 		 465 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  31.53 
 
 		 455 aa  202  7e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  32.02 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  31.58 
 
 		 949 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  35.17 
 
 		 476 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  29.98 
 
 		 518 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  30.75 
 
 		 442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  33.65 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  34.29 
 
 		 461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  31.12 
 
 		 949 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  35.07 
 
 		 443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  34.36 
 
 		 469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  33.33 
 
 		 461 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  33.49 
 
 		 451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  30.57 
 
 		 459 aa  197  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  31.34 
 
 		 949 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  29.16 
 
 		 550 aa  196  5.000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.346187 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0896  M16 family peptidase  29.75 
 
 		 416 aa  196  6e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.121983  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0826  M16 family peptidase  29.75 
 
 		 416 aa  196  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106023  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  30.95 
 
 		 454 aa  196  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>