More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1097 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  90.4 
 
 
448 aa  829    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  100 
 
 
448 aa  905    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
448 aa  905    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  65.32 
 
 
453 aa  566  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  63.47 
 
 
477 aa  557  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  58.56 
 
 
463 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  56.67 
 
 
472 aa  471  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  52.91 
 
 
461 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  52.91 
 
 
476 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  51.59 
 
 
463 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  50.94 
 
 
461 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  53.08 
 
 
469 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  51.83 
 
 
489 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  50.47 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  48.57 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  51.8 
 
 
457 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  51.56 
 
 
469 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  50.95 
 
 
454 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  51.31 
 
 
460 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  50.95 
 
 
459 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  50.72 
 
 
468 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  50.48 
 
 
459 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  51.31 
 
 
460 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  51.31 
 
 
460 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  50.34 
 
 
459 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  44.06 
 
 
513 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  47.55 
 
 
514 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  47.12 
 
 
456 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  41.23 
 
 
467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  43.3 
 
 
453 aa  323  6e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  40.27 
 
 
470 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  44.8 
 
 
470 aa  301  1e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  42.89 
 
 
453 aa  287  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  42.18 
 
 
466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  38.48 
 
 
459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  40 
 
 
465 aa  280  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  36.26 
 
 
453 aa  276  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  37.21 
 
 
506 aa  275  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  40.15 
 
 
452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  38.02 
 
 
455 aa  274  3e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  35.47 
 
 
441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  41.87 
 
 
459 aa  270  4e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  35.47 
 
 
441 aa  270  4e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  39 
 
 
501 aa  269  7e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  37.99 
 
 
504 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  37.83 
 
 
494 aa  266  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  35.87 
 
 
454 aa  264  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  39.67 
 
 
499 aa  263  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  37.11 
 
 
477 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  38.31 
 
 
484 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  35.88 
 
 
442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  40.05 
 
 
484 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  35.65 
 
 
459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  40.05 
 
 
484 aa  254  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  36.57 
 
 
492 aa  252  9.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0849  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  32.96 
 
 
438 aa  251  2e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.745956  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1057  M16 family peptidase  33.41 
 
 
439 aa  249  5e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  41.11 
 
 
509 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  36.34 
 
 
493 aa  249  9e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  37.25 
 
 
465 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  37.25 
 
 
465 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  35.14 
 
 
450 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  35.28 
 
 
453 aa  249  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  40.84 
 
 
473 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  39.17 
 
 
462 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  37.47 
 
 
448 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  35.14 
 
 
450 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  34.43 
 
 
493 aa  246  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  35.21 
 
 
489 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  35.58 
 
 
451 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  39.56 
 
 
479 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  34.34 
 
 
451 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  35.4 
 
 
451 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  35.4 
 
 
451 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  34.65 
 
 
451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  34.4 
 
 
455 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  36.98 
 
 
460 aa  227  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  38.91 
 
 
481 aa  225  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  36.85 
 
 
443 aa  223  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  31.17 
 
 
447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  33.17 
 
 
530 aa  219  5e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  35.29 
 
 
441 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  34.93 
 
 
457 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0761  insulinase family protease  29.79 
 
 
446 aa  209  6e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.126087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  35.04 
 
 
457 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  31.25 
 
 
433 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  34.83 
 
 
876 aa  206  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  30.18 
 
 
461 aa  203  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  31.51 
 
 
441 aa  202  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  31.01 
 
 
433 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  34.38 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0627  peptidase, M16 family  30.17 
 
 
417 aa  201  3e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  29.52 
 
 
440 aa  201  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  31.8 
 
 
443 aa  199  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0582  M16 family peptidase  29.11 
 
 
414 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0896  M16 family peptidase  30.64 
 
 
416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.121983  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0826  M16 family peptidase  30.64 
 
 
416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106023  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  29.93 
 
 
422 aa  196  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  29.95 
 
 
929 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  29.65 
 
 
433 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>