More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1632 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
454 aa  942    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  85.71 
 
 
455 aa  819    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  53.16 
 
 
506 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  54.78 
 
 
504 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  53.41 
 
 
465 aa  497  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  53.36 
 
 
501 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  53.4 
 
 
494 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  51.35 
 
 
470 aa  487  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  53.66 
 
 
477 aa  484  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  52.15 
 
 
452 aa  478  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  53.76 
 
 
470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  51.36 
 
 
453 aa  466  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  47.64 
 
 
492 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  47.39 
 
 
466 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  49.88 
 
 
479 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  48.82 
 
 
509 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  46.51 
 
 
459 aa  410  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  45.41 
 
 
499 aa  411  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  45.83 
 
 
484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  47.27 
 
 
484 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  44.12 
 
 
441 aa  398  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  46.02 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  46.99 
 
 
481 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  47.26 
 
 
484 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  43.88 
 
 
441 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  47.71 
 
 
473 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  44.1 
 
 
453 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  40.09 
 
 
459 aa  375  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  41.31 
 
 
442 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  42.42 
 
 
448 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  43.69 
 
 
451 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  42.72 
 
 
465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  42.72 
 
 
465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  44.63 
 
 
493 aa  351  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  42.52 
 
 
451 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  42.52 
 
 
451 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  41.36 
 
 
450 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  41.59 
 
 
450 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  42.72 
 
 
462 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  42.29 
 
 
451 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  41.65 
 
 
451 aa  346  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  43.86 
 
 
489 aa  344  1e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  42.03 
 
 
455 aa  342  9e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  41.9 
 
 
460 aa  340  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  38.75 
 
 
493 aa  316  5e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  40.05 
 
 
530 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  39.71 
 
 
469 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  37.77 
 
 
443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  38.34 
 
 
453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  37.06 
 
 
477 aa  288  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  37.35 
 
 
476 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  37.75 
 
 
461 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  35.59 
 
 
461 aa  276  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  35.03 
 
 
513 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  36.48 
 
 
459 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  34.84 
 
 
514 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  37.01 
 
 
460 aa  269  7e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  37.01 
 
 
460 aa  269  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  36.54 
 
 
463 aa  269  7e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  34.13 
 
 
457 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  36.52 
 
 
489 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  36.67 
 
 
460 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  35.54 
 
 
454 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  35.87 
 
 
448 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  35.87 
 
 
448 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  36.34 
 
 
468 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  34.13 
 
 
457 aa  263  6e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  35.14 
 
 
448 aa  262  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  35.21 
 
 
457 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  35.89 
 
 
456 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  36.99 
 
 
472 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  35.08 
 
 
459 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  35.52 
 
 
464 aa  261  3e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  33.65 
 
 
428 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  33.65 
 
 
441 aa  259  9e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  35.21 
 
 
467 aa  256  5e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  35.64 
 
 
464 aa  256  7e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  34.74 
 
 
469 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  34.24 
 
 
459 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  32.41 
 
 
453 aa  253  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  34.67 
 
 
453 aa  249  7e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  33.81 
 
 
463 aa  247  4e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  31.02 
 
 
447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  32.09 
 
 
433 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  33.94 
 
 
876 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  32.01 
 
 
433 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  32.63 
 
 
447 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  30.3 
 
 
443 aa  225  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  31.31 
 
 
440 aa  223  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  31.27 
 
 
433 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  32.86 
 
 
464 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  32.95 
 
 
431 aa  218  1e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1139  M16 family peptidase  33.09 
 
 
413 aa  219  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  34.24 
 
 
434 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  31.28 
 
 
442 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0582  M16 family peptidase  32.22 
 
 
414 aa  211  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  29.83 
 
 
518 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  30.3 
 
 
443 aa  208  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  30.72 
 
 
424 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  30.97 
 
 
443 aa  206  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>