More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1009 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
468 aa  964    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  74.04 
 
 
457 aa  691    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  60.53 
 
 
469 aa  525  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  59.86 
 
 
460 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  58.24 
 
 
469 aa  522  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  59.86 
 
 
460 aa  522  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  59.11 
 
 
460 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  58.33 
 
 
459 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  58.49 
 
 
454 aa  513  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  56.48 
 
 
459 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  55.31 
 
 
461 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  54.08 
 
 
463 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  54.04 
 
 
476 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  53.5 
 
 
489 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  54.22 
 
 
464 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  53.73 
 
 
461 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  51.96 
 
 
464 aa  455  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  46.71 
 
 
513 aa  434  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  48.71 
 
 
514 aa  427  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  51.2 
 
 
448 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  51.2 
 
 
448 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  50.72 
 
 
448 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  46.7 
 
 
477 aa  398  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  47.95 
 
 
459 aa  381  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  46.38 
 
 
456 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  46.99 
 
 
453 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  47.12 
 
 
472 aa  358  8e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  46.52 
 
 
463 aa  358  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  44.34 
 
 
453 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  43.13 
 
 
467 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  43.8 
 
 
470 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  40.38 
 
 
470 aa  299  6e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  40.53 
 
 
453 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  38.78 
 
 
465 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  40.46 
 
 
453 aa  288  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1057  M16 family peptidase  36.3 
 
 
439 aa  286  4e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0849  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  35.45 
 
 
438 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.745956  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  41.58 
 
 
452 aa  283  5.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  36.93 
 
 
441 aa  282  9e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  36.93 
 
 
441 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  40.43 
 
 
494 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  39.95 
 
 
477 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  38.92 
 
 
459 aa  279  6e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  37.56 
 
 
455 aa  277  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  40.52 
 
 
466 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  36.34 
 
 
454 aa  272  7e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  39.1 
 
 
501 aa  272  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  40.49 
 
 
459 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  36.98 
 
 
504 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  39.06 
 
 
484 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  36.04 
 
 
442 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  38.31 
 
 
499 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  35.71 
 
 
493 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  35.8 
 
 
459 aa  259  6e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  42.07 
 
 
473 aa  257  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  37.41 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  39.38 
 
 
484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0761  insulinase family protease  34.84 
 
 
446 aa  253  7e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.126087  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  39.14 
 
 
484 aa  252  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  39.37 
 
 
509 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  36.03 
 
 
492 aa  250  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  35.4 
 
 
493 aa  250  5e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  35.15 
 
 
453 aa  249  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  36.7 
 
 
460 aa  247  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  35.17 
 
 
506 aa  247  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  36.69 
 
 
448 aa  246  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  33.97 
 
 
489 aa  246  9e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  37.35 
 
 
479 aa  245  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  35.58 
 
 
465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  35.58 
 
 
465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  37.95 
 
 
443 aa  243  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  34.18 
 
 
450 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  33.72 
 
 
450 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  39.18 
 
 
481 aa  232  9e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  33.79 
 
 
455 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  32.94 
 
 
451 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  33.49 
 
 
530 aa  222  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  32.7 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  33.57 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  32.33 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  32.46 
 
 
451 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  32.58 
 
 
457 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  32.41 
 
 
457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  32.41 
 
 
441 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0896  M16 family peptidase  31.57 
 
 
416 aa  210  5e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.121983  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0826  M16 family peptidase  31.57 
 
 
416 aa  210  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106023  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0582  M16 family peptidase  30 
 
 
414 aa  209  9e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0627  peptidase, M16 family  32.22 
 
 
417 aa  207  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0914  M16 family peptidase  31.95 
 
 
437 aa  206  9e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000029029  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1205  M16 family peptidase  30.99 
 
 
416 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.75942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  32.81 
 
 
428 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  31.18 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  34.41 
 
 
434 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  33.25 
 
 
458 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0785  M16 family peptidase  30.95 
 
 
415 aa  199  9e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  30.79 
 
 
518 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  31.25 
 
 
876 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  30.55 
 
 
431 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  33.65 
 
 
439 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0119  cytochrome c551 peroxidase (cytochrome cperoxidase)  30.62 
 
 
413 aa  196  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.369766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>