More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0377 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  100 
 
 		 453 aa  925    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  57.71 
 
 		 465 aa  537  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  59.72 
 
 		 470 aa  535  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  53.66 
 
 		 452 aa  507  9.999999999999999e-143  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  53.86 
 
 		 494 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  55.78 
 
 		 470 aa  479  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  53.85 
 
 		 501 aa  478  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  53.4 
 
 		 477 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  52.07 
 
 		 504 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  51.72 
 
 		 506 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  51.36 
 
 		 454 aa  466  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  51.83 
 
 		 455 aa  463  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  48.68 
 
 		 459 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  54.29 
 
 		 459 aa  442  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  51.76 
 
 		 466 aa  438  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  47.57 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  47.57 
 
 		 441 aa  422  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  50.23 
 
 		 484 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  46.71 
 
 		 453 aa  413  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  49.53 
 
 		 492 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  52.15 
 
 		 484 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  51.91 
 
 		 484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  51.03 
 
 		 479 aa  405  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  51.39 
 
 		 509 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  43.51 
 
 		 459 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  43.85 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  44.35 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  45.85 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  46.08 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  46.42 
 
 		 462 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  49.16 
 
 		 473 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  46.17 
 
 		 481 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  45.91 
 
 		 448 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  44.11 
 
 		 451 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  45.65 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  45.65 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  45.69 
 
 		 493 aa  365  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  47.62 
 
 		 460 aa  363  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  44.82 
 
 		 451 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  44.82 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  44.58 
 
 		 451 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  44.58 
 
 		 451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  44.55 
 
 		 455 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  46.38 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  42.79 
 
 		 493 aa  344  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  42.58 
 
 		 489 aa  336  5.999999999999999e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  40.29 
 
 		 530 aa  311  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  43.65 
 
 		 459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  41.3 
 
 		 453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  42.43 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  39.44 
 
 		 469 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  39.72 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  39.15 
 
 		 463 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  43.21 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  35.65 
 
 		 513 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  37.35 
 
 		 514 aa  292  7e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  38.86 
 
 		 461 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  39.71 
 
 		 477 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  43.48 
 
 		 472 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  38.48 
 
 		 476 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  40.53 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  40 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  42.89 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  42.89 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  41.95 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  40.52 
 
 		 469 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  38.52 
 
 		 489 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  39.1 
 
 		 464 aa  281  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  40.59 
 
 		 459 aa  279  9e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  42.59 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  42.59 
 
 		 460 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  42.06 
 
 		 460 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  39.58 
 
 		 454 aa  278  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  40.62 
 
 		 453 aa  275  9e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  39.6 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  37.72 
 
 		 467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  37.56 
 
 		 457 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  37.96 
 
 		 463 aa  266  5e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  37.56 
 
 		 441 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  38.35 
 
 		 876 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  37.32 
 
 		 457 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  37.56 
 
 		 428 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  34.35 
 
 		 431 aa  257  4e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  36.07 
 
 		 443 aa  256  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  34.52 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  36.19 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  37.59 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  38.05 
 
 		 422 aa  243  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  34.23 
 
 		 433 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 		 461 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  37.35 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  38.08 
 
 		 458 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  33.92 
 
 		 453 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  33.89 
 
 		 433 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  35.48 
 
 		 442 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  33.74 
 
 		 433 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  36.07 
 
 		 424 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  34.47 
 
 		 440 aa  233  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  32.94 
 
 		 443 aa  233  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  33.12 
 
 		 550 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.346187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>