More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5112 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  100 
 
 		 451 aa  920    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  98.23 
 
 		 451 aa  907    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  83.07 
 
 		 450 aa  780    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  84.19 
 
 		 450 aa  789    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  76.94 
 
 		 455 aa  705    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  82.04 
 
 		 451 aa  775    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  99.56 
 
 		 451 aa  915    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  74.78 
 
 		 465 aa  689    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  96.23 
 
 		 451 aa  863    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  74.78 
 
 		 465 aa  689    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  76.05 
 
 		 448 aa  689    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  47.48 
 
 		 453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  49.64 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  47.84 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  47.6 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  48.44 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  43.72 
 
 		 459 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  45.91 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  43.76 
 
 		 465 aa  368  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  44.11 
 
 		 493 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  44.01 
 
 		 453 aa  365  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  43.52 
 
 		 530 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  43.75 
 
 		 489 aa  363  3e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  41.16 
 
 		 442 aa  360  2e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  41.01 
 
 		 459 aa  360  2e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  40.77 
 
 		 452 aa  353  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  42.21 
 
 		 504 aa  349  6e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  41.78 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  42.52 
 
 		 454 aa  348  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  40.09 
 
 		 477 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  41.12 
 
 		 455 aa  339  5e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  44.27 
 
 		 470 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  44.76 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  40.67 
 
 		 494 aa  335  9e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  41 
 
 		 501 aa  334  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  42.89 
 
 		 460 aa  331  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  43.86 
 
 		 462 aa  329  7e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  40.45 
 
 		 492 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  41.51 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  41.57 
 
 		 484 aa  297  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  40.85 
 
 		 484 aa  297  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  38.19 
 
 		 453 aa  296  6e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  39.09 
 
 		 499 aa  294  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  39.72 
 
 		 493 aa  292  7e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  39.19 
 
 		 433 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  38.72 
 
 		 433 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  41.81 
 
 		 479 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  37.91 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  38.24 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  37.69 
 
 		 459 aa  266  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  36.47 
 
 		 463 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  40.19 
 
 		 473 aa  265  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  39.13 
 
 		 481 aa  264  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  37.24 
 
 		 461 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  38.23 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  36.6 
 
 		 461 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  36.64 
 
 		 464 aa  255  9e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  35.9 
 
 		 476 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  35.8 
 
 		 489 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  36.34 
 
 		 456 aa  251  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  36.32 
 
 		 464 aa  249  7e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  35.21 
 
 		 514 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  36.38 
 
 		 472 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  35.01 
 
 		 469 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  34.74 
 
 		 513 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  35.21 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  35.48 
 
 		 453 aa  238  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  35.54 
 
 		 448 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  35.54 
 
 		 448 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  36.36 
 
 		 459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  36.07 
 
 		 477 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  35.18 
 
 		 457 aa  230  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  34.99 
 
 		 463 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  34.68 
 
 		 459 aa  227  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  35.63 
 
 		 454 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  35.14 
 
 		 469 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  32.2 
 
 		 443 aa  219  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  32.94 
 
 		 468 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  34.88 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  33.41 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  32.71 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  34.64 
 
 		 460 aa  216  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  34.64 
 
 		 460 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  33.02 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  35.83 
 
 		 876 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  33.17 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  32.71 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  32.21 
 
 		 441 aa  207  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  32.95 
 
 		 945 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  31 
 
 		 442 aa  206  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  32.31 
 
 		 458 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  32.31 
 
 		 458 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  32.31 
 
 		 458 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  32.55 
 
 		 944 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  30.47 
 
 		 443 aa  204  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  30.61 
 
 		 494 aa  203  4e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  31.98 
 
 		 443 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  32.25 
 
 		 443 aa  203  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  30.97 
 
 		 453 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  31.08 
 
 		 443 aa  202  8e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>