More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1927 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
455 aa  941    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  85.71 
 
 
454 aa  819    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  57.24 
 
 
504 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  57.04 
 
 
506 aa  521  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  54.4 
 
 
465 aa  499  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  55.04 
 
 
501 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  54.88 
 
 
477 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  55.08 
 
 
494 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  54.04 
 
 
452 aa  487  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  50.9 
 
 
470 aa  487  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  51.83 
 
 
453 aa  463  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  52.73 
 
 
470 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  48.72 
 
 
492 aa  420  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  46.56 
 
 
499 aa  421  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  50.12 
 
 
509 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  50.12 
 
 
479 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  48.81 
 
 
484 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  47.58 
 
 
459 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  49.04 
 
 
484 aa  411  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  48.33 
 
 
481 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  46.76 
 
 
484 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  45.52 
 
 
441 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  45.28 
 
 
441 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  46.49 
 
 
466 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  46.28 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  49.52 
 
 
473 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  42.95 
 
 
459 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  44.42 
 
 
442 aa  392  1e-108  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  42.13 
 
 
453 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  43.06 
 
 
462 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  43.63 
 
 
493 aa  354  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  43.59 
 
 
489 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  42.76 
 
 
465 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  42.76 
 
 
465 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  41.94 
 
 
448 aa  347  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  41.36 
 
 
450 aa  347  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  40.77 
 
 
451 aa  345  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  42.7 
 
 
455 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  41.59 
 
 
451 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  40.66 
 
 
460 aa  341  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  41.59 
 
 
451 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  40.89 
 
 
450 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  41.36 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  41.36 
 
 
451 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  39.9 
 
 
530 aa  317  2e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  39.04 
 
 
493 aa  315  9e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  39.11 
 
 
469 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  37.42 
 
 
453 aa  305  8.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  37.53 
 
 
443 aa  298  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  38.16 
 
 
461 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  36.79 
 
 
476 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  37.38 
 
 
477 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  36.3 
 
 
513 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  35 
 
 
514 aa  276  6e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  38.1 
 
 
472 aa  275  9e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  37.29 
 
 
460 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  37.29 
 
 
460 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  38.02 
 
 
448 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  38.02 
 
 
448 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  37.09 
 
 
460 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  36.86 
 
 
448 aa  269  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  36.56 
 
 
464 aa  269  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  37.56 
 
 
468 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  35.25 
 
 
464 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  35.27 
 
 
461 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  37.73 
 
 
459 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  35.7 
 
 
463 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  35.11 
 
 
454 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  36.79 
 
 
457 aa  265  1e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  34.54 
 
 
489 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  37.31 
 
 
463 aa  262  6.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  33.73 
 
 
457 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  37.47 
 
 
469 aa  260  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  33.73 
 
 
457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  35.38 
 
 
456 aa  255  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  35.8 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  33.49 
 
 
441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  33.64 
 
 
453 aa  253  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  33.17 
 
 
459 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  34.59 
 
 
467 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  32.45 
 
 
428 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  34.38 
 
 
459 aa  248  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  35.73 
 
 
876 aa  247  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  33.64 
 
 
447 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  31.94 
 
 
433 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  32.26 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  31.95 
 
 
433 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  30.81 
 
 
447 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  34.38 
 
 
434 aa  224  3e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  32.87 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  31.69 
 
 
443 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  31.69 
 
 
443 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  31.69 
 
 
443 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  32.45 
 
 
431 aa  218  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  29.16 
 
 
443 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  31.91 
 
 
468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  31.28 
 
 
442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  31 
 
 
443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  32.36 
 
 
441 aa  217  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2530  peptidase M16-like  30.18 
 
 
496 aa  216  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>