More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3719 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  100 
 
 
452 aa  929    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  58.24 
 
 
470 aa  538  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  57.77 
 
 
465 aa  527  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  53.66 
 
 
453 aa  507  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  54.75 
 
 
470 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  55.92 
 
 
506 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  55.24 
 
 
504 aa  492  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  54.04 
 
 
455 aa  487  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  54.86 
 
 
501 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  52.74 
 
 
494 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  52.15 
 
 
454 aa  478  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  52.9 
 
 
477 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  51 
 
 
492 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  48.47 
 
 
466 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  46.05 
 
 
459 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  47.45 
 
 
499 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  51.16 
 
 
509 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  48.72 
 
 
484 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  49.77 
 
 
484 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  51.9 
 
 
473 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  50.72 
 
 
459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  50.24 
 
 
484 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  44.74 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  44.5 
 
 
441 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  50.45 
 
 
481 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  47.86 
 
 
479 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  46.39 
 
 
453 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  41.26 
 
 
459 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  41.88 
 
 
442 aa  375  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  42.89 
 
 
465 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  42.89 
 
 
465 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  41.78 
 
 
450 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  41.55 
 
 
450 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  42.76 
 
 
462 aa  358  9e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  42.31 
 
 
448 aa  358  9e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  42.45 
 
 
493 aa  355  6.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  41.61 
 
 
451 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  41.59 
 
 
451 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  41.59 
 
 
451 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  40.87 
 
 
451 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  41.35 
 
 
451 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  43.27 
 
 
460 aa  347  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  41.97 
 
 
489 aa  345  8.999999999999999e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  40.76 
 
 
455 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  41.5 
 
 
493 aa  340  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  41.57 
 
 
530 aa  329  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  40.32 
 
 
459 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  39.42 
 
 
443 aa  300  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  38.07 
 
 
453 aa  298  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  41.18 
 
 
469 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  38.02 
 
 
514 aa  295  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  40.09 
 
 
457 aa  292  9e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  38.42 
 
 
513 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  39.44 
 
 
463 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  41.25 
 
 
472 aa  289  8e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  38.81 
 
 
461 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  39.52 
 
 
464 aa  286  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  39.91 
 
 
489 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  39.61 
 
 
477 aa  283  6.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  38.33 
 
 
476 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  39.05 
 
 
456 aa  279  9e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  40 
 
 
448 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  37.82 
 
 
461 aa  276  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  40.15 
 
 
448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  40.15 
 
 
448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  36.36 
 
 
457 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  37.83 
 
 
464 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  39.27 
 
 
459 aa  269  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  36.98 
 
 
428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  41.58 
 
 
468 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  36.36 
 
 
457 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  36.12 
 
 
441 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  39 
 
 
454 aa  265  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  37.8 
 
 
459 aa  263  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  38.78 
 
 
469 aa  262  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  39.75 
 
 
460 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  39.75 
 
 
460 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  38.03 
 
 
453 aa  258  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  38.64 
 
 
463 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  35.68 
 
 
453 aa  258  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  35.6 
 
 
441 aa  256  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  39 
 
 
460 aa  255  9e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  35.98 
 
 
876 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  35.16 
 
 
443 aa  252  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  34.09 
 
 
440 aa  252  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  35.45 
 
 
442 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  34.55 
 
 
443 aa  251  2e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  34.96 
 
 
443 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  32.74 
 
 
461 aa  247  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  33.26 
 
 
443 aa  247  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  35.75 
 
 
467 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  32.43 
 
 
447 aa  243  3.9999999999999997e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  33.62 
 
 
526 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  33.94 
 
 
443 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  33.94 
 
 
443 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  33.94 
 
 
443 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  33.94 
 
 
443 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  33.71 
 
 
443 aa  236  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  32.5 
 
 
431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2773  peptidase M16-like  34.05 
 
 
550 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.346187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>