More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0704 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  100 
 
 
411 aa  858    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  59.56 
 
 
414 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  57.6 
 
 
411 aa  500  1e-140  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  57.11 
 
 
413 aa  495  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  56.13 
 
 
413 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  50.98 
 
 
411 aa  432  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  37.59 
 
 
458 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  37.35 
 
 
458 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  36.71 
 
 
458 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  34.59 
 
 
440 aa  243  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  35.09 
 
 
440 aa  243  5e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  33.66 
 
 
422 aa  239  8e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  36.14 
 
 
442 aa  232  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  36.41 
 
 
443 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  36.41 
 
 
443 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  36.16 
 
 
443 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  36.41 
 
 
443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  36.16 
 
 
443 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  35.91 
 
 
443 aa  225  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  35.91 
 
 
443 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  35.91 
 
 
443 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3796  peptidase M16-like  36.03 
 
 
433 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0607988  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  36.14 
 
 
443 aa  220  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  35.66 
 
 
443 aa  219  7e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  35.66 
 
 
443 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4238  peptidase M16 domain protein  34.31 
 
 
436 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259515  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  35.16 
 
 
443 aa  218  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  32.84 
 
 
493 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  34.91 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  34.37 
 
 
949 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  35.66 
 
 
441 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  38.66 
 
 
959 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  39.26 
 
 
960 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  33.17 
 
 
453 aa  210  4e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  38.99 
 
 
962 aa  210  5e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  31.45 
 
 
443 aa  208  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  34.32 
 
 
447 aa  208  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  35.48 
 
 
952 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  34.48 
 
 
956 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  33.42 
 
 
443 aa  205  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  33.41 
 
 
921 aa  205  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06870  predicted Zn-dependent peptidase  35.7 
 
 
428 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.677092  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  32.21 
 
 
969 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  42.71 
 
 
967 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0931  peptidase M16 domain-containing protein  35.32 
 
 
428 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557944  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  36.12 
 
 
470 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  32.03 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  32.03 
 
 
457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  33 
 
 
470 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  35.38 
 
 
901 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  32.03 
 
 
441 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  34.78 
 
 
930 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  33.02 
 
 
943 aa  196  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  34.22 
 
 
429 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0863  peptidase M16 domain protein  35.34 
 
 
428 aa  196  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282828  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  34.67 
 
 
903 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  32.19 
 
 
944 aa  194  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  33.08 
 
 
943 aa  194  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  31.3 
 
 
465 aa  194  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  31.8 
 
 
947 aa  193  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  34.67 
 
 
904 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  33.09 
 
 
945 aa  192  7e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  33.89 
 
 
429 aa  192  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  32.52 
 
 
929 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  32.52 
 
 
949 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  31.98 
 
 
945 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  32.08 
 
 
947 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1775  peptidase M16 domain-containing protein  31.87 
 
 
438 aa  189  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  29.6 
 
 
431 aa  189  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  32.37 
 
 
950 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  32.37 
 
 
944 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  32.09 
 
 
947 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  31.58 
 
 
442 aa  188  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  32.37 
 
 
950 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  31.7 
 
 
949 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  31.57 
 
 
944 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  32.37 
 
 
950 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  30.85 
 
 
959 aa  187  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3747  peptidase M16 domain-containing protein  31.26 
 
 
448 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  31.45 
 
 
949 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  31.94 
 
 
949 aa  186  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  31.33 
 
 
459 aa  186  5e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4128  peptidase M16 domain-containing protein  32.21 
 
 
437 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  31.34 
 
 
452 aa  186  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  31.45 
 
 
949 aa  186  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  32.84 
 
 
945 aa  186  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  30.39 
 
 
441 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  30.24 
 
 
489 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  31.05 
 
 
944 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  30.15 
 
 
441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  30.96 
 
 
944 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  31.25 
 
 
974 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  29.71 
 
 
954 aa  183  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  31.09 
 
 
428 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  37.71 
 
 
423 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  29.8 
 
 
470 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  28.75 
 
 
493 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  30.24 
 
 
958 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  30.9 
 
 
950 aa  181  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  31.37 
 
 
482 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>