More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4179 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  77.17 
 
 		 464 aa  707    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  100 
 
 		 476 aa  969    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  80.82 
 
 		 489 aa  742    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  89.15 
 
 		 461 aa  830    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  78.49 
 
 		 464 aa  716    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  73.39 
 
 		 461 aa  696    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  84.47 
 
 		 463 aa  767    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  57.93 
 
 		 469 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  56.13 
 
 		 457 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  55.4 
 
 		 469 aa  477  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  53.69 
 
 		 454 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  54.7 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  54.46 
 
 		 459 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  53.12 
 
 		 460 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  53.12 
 
 		 460 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  54.04 
 
 		 468 aa  463  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  52.66 
 
 		 460 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  53.32 
 
 		 448 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  53.32 
 
 		 448 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  49.11 
 
 		 513 aa  440  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  52.74 
 
 		 448 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  49.52 
 
 		 514 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  48.41 
 
 		 477 aa  423  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  48.2 
 
 		 453 aa  401  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  46.82 
 
 		 456 aa  398  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  46.92 
 
 		 459 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  44.7 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  44.37 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  43.86 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  47.27 
 
 		 472 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  42.25 
 
 		 466 aa  311  1e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  42.42 
 
 		 470 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  38.88 
 
 		 465 aa  294  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  38.48 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  36.79 
 
 		 455 aa  290  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  38.27 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  38.44 
 
 		 453 aa  290  4e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  38.52 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  38.69 
 
 		 470 aa  287  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  37.61 
 
 		 459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  37.35 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  38.16 
 
 		 452 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  36.92 
 
 		 504 aa  279  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  38.44 
 
 		 462 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  40.69 
 
 		 459 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  38.1 
 
 		 506 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  36.47 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  36.81 
 
 		 492 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  36.74 
 
 		 442 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  35.78 
 
 		 459 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  37.88 
 
 		 501 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  39.22 
 
 		 509 aa  266  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  36.82 
 
 		 494 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  35.95 
 
 		 477 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  38.55 
 
 		 484 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  38.55 
 
 		 484 aa  263  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  37.18 
 
 		 499 aa  262  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0849  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  35.85 
 
 		 438 aa  261  2e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.745956  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  38.1 
 
 		 484 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  35.9 
 
 		 450 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  36.43 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1057  M16 family peptidase  35.56 
 
 		 439 aa  257  3e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  35.68 
 
 		 450 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  35.83 
 
 		 451 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  33.64 
 
 		 493 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  35.61 
 
 		 493 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  35.83 
 
 		 451 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  35.36 
 
 		 451 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  37.18 
 
 		 479 aa  250  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  35.6 
 
 		 451 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  35.75 
 
 		 455 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  35.32 
 
 		 465 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  35.32 
 
 		 465 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  34.22 
 
 		 489 aa  247  4e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  37.68 
 
 		 443 aa  246  6e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  38.61 
 
 		 473 aa  246  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  34.44 
 
 		 460 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  38.16 
 
 		 481 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  34.87 
 
 		 530 aa  240  5e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  34.55 
 
 		 451 aa  239  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_002978  WD0761  insulinase family protease  32.11 
 
 		 446 aa  226  6e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.126087  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  32.43 
 
 		 431 aa  226  8e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  35.04 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  35.04 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0627  peptidase, M16 family  31.4 
 
 		 417 aa  223  4e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  34.88 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0914  M16 family peptidase  33.73 
 
 		 437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000029029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0896  M16 family peptidase  31.4 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.121983  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0826  M16 family peptidase  31.4 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106023  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  34.12 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0582  M16 family peptidase  32.59 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  34.12 
 
 		 458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  34.19 
 
 		 458 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  33.11 
 
 		 443 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  32.88 
 
 		 443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  32.88 
 
 		 443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0785  M16 family peptidase  33.25 
 
 		 415 aa  213  7.999999999999999e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1205  M16 family peptidase  30.83 
 
 		 416 aa  212  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.75942  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  33.64 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  32.19 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>