More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0094 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  100 
 
 		 477 aa  969    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  63.47 
 
 		 448 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  63.47 
 
 		 448 aa  557  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  63 
 
 		 448 aa  554  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  64.86 
 
 		 453 aa  552  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  55.63 
 
 		 463 aa  487  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  55.74 
 
 		 472 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  49.53 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  49.18 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  47.79 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  49.65 
 
 		 469 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  48.37 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  49.76 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  47.48 
 
 		 460 aa  408  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  47.48 
 
 		 460 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  47.55 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  47.99 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  46.83 
 
 		 460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  47.6 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  47.28 
 
 		 459 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  46.86 
 
 		 464 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  47.2 
 
 		 489 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  46.23 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  46.7 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  47.27 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  47.28 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  48.23 
 
 		 514 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  43.93 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  44.1 
 
 		 467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  42.48 
 
 		 453 aa  318  9e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  40.96 
 
 		 470 aa  309  8e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  40.67 
 
 		 465 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  39.71 
 
 		 453 aa  290  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  37.06 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  40.61 
 
 		 466 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  42.82 
 
 		 470 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  37.38 
 
 		 455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  39.61 
 
 		 452 aa  283  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  37.88 
 
 		 453 aa  273  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  38.02 
 
 		 504 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  37.16 
 
 		 441 aa  272  1e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  37.16 
 
 		 441 aa  272  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  38.76 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  36.9 
 
 		 506 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  36.97 
 
 		 453 aa  270  4e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  38.81 
 
 		 501 aa  269  8e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  36.82 
 
 		 477 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  40 
 
 		 484 aa  269  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  37.74 
 
 		 494 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  40 
 
 		 459 aa  266  5e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  40.43 
 
 		 499 aa  263  6e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  38.17 
 
 		 492 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  37.38 
 
 		 459 aa  259  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0849  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  33.01 
 
 		 438 aa  258  1e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.745956  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1057  M16 family peptidase  33.73 
 
 		 439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  37.09 
 
 		 460 aa  254  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  37.75 
 
 		 448 aa  253  5.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  37.32 
 
 		 443 aa  253  6e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  40.25 
 
 		 509 aa  251  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  39.04 
 
 		 493 aa  251  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  38.81 
 
 		 484 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  35.8 
 
 		 465 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  35.8 
 
 		 465 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  34.57 
 
 		 493 aa  246  8e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  34.15 
 
 		 442 aa  246  9e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  38.81 
 
 		 484 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  33.9 
 
 		 459 aa  244  3e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  34.57 
 
 		 489 aa  242  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  35.75 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  40.09 
 
 		 481 aa  240  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  38.26 
 
 		 479 aa  239  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  39.6 
 
 		 473 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  35.22 
 
 		 450 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0761  insulinase family protease  34.67 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.126087  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  35.53 
 
 		 450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  36.3 
 
 		 451 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  36.07 
 
 		 451 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  34.51 
 
 		 876 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  36.07 
 
 		 451 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  35.83 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  35.54 
 
 		 455 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  30 
 
 		 530 aa  223  7e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  31.28 
 
 		 447 aa  216  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  35.25 
 
 		 457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0627  peptidase, M16 family  30.32 
 
 		 417 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  32.67 
 
 		 433 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  34.73 
 
 		 441 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  36.29 
 
 		 422 aa  209  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  30.89 
 
 		 443 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  30.89 
 
 		 443 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  34.46 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  31.69 
 
 		 443 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  32.76 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  34.1 
 
 		 428 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  32.42 
 
 		 433 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  30.67 
 
 		 443 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  31.69 
 
 		 443 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  31.69 
 
 		 443 aa  206  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  31.24 
 
 		 443 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  31.46 
 
 		 443 aa  206  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>