More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0242 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  85.45 
 
 		 501 aa  848    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  100 
 
 		 477 aa  984    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  97 
 
 		 494 aa  926    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  68.53 
 
 		 506 aa  632  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  65.49 
 
 		 504 aa  632  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  54.88 
 
 		 455 aa  493  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  55.53 
 
 		 470 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  53.71 
 
 		 465 aa  489  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  53.66 
 
 		 454 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  53.4 
 
 		 453 aa  478  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  52.39 
 
 		 470 aa  472  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  52.9 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  50.54 
 
 		 484 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  53.44 
 
 		 484 aa  443  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  53.68 
 
 		 484 aa  444  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  51.76 
 
 		 479 aa  433  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  46.54 
 
 		 499 aa  430  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  50.8 
 
 		 509 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  47.82 
 
 		 492 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  50.68 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  47.66 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  50 
 
 		 459 aa  411  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  51.9 
 
 		 473 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  45.79 
 
 		 459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  43.65 
 
 		 441 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  43.41 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  43.12 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  42.89 
 
 		 459 aa  375  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  41.72 
 
 		 453 aa  361  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  43.06 
 
 		 448 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  42.73 
 
 		 462 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  42.08 
 
 		 465 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  42.08 
 
 		 465 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  41.75 
 
 		 451 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  41.22 
 
 		 451 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  40.24 
 
 		 450 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  40.75 
 
 		 451 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  40 
 
 		 450 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  40.28 
 
 		 451 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  40.28 
 
 		 451 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  41.87 
 
 		 455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  41.47 
 
 		 443 aa  323  4e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  39.23 
 
 		 493 aa  322  9.000000000000001e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  38.66 
 
 		 513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  39.52 
 
 		 460 aa  302  8.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  36.73 
 
 		 489 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  38.89 
 
 		 514 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  36.83 
 
 		 493 aa  297  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  38.9 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  37.53 
 
 		 453 aa  282  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  32.85 
 
 		 530 aa  274  3e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  39.71 
 
 		 468 aa  270  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  36.82 
 
 		 477 aa  269  8.999999999999999e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  37.95 
 
 		 456 aa  266  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  37.1 
 
 		 461 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  36.94 
 
 		 459 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  37.41 
 
 		 463 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  36.82 
 
 		 476 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  35.12 
 
 		 461 aa  262  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  37.67 
 
 		 472 aa  262  8e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  37.11 
 
 		 448 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  37.11 
 
 		 448 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  37.02 
 
 		 448 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  35.23 
 
 		 469 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  36.9 
 
 		 460 aa  257  3e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  36.67 
 
 		 460 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  36.9 
 
 		 460 aa  257  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  36.19 
 
 		 464 aa  256  9e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  36.23 
 
 		 464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  36.23 
 
 		 489 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  36.22 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  36.61 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  35.27 
 
 		 467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  35.23 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  37.05 
 
 		 457 aa  251  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  34.4 
 
 		 459 aa  249  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  34.88 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  34.14 
 
 		 428 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  33.66 
 
 		 441 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  35.8 
 
 		 463 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  34.7 
 
 		 443 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  35.18 
 
 		 443 aa  237  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  35.21 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  33.95 
 
 		 443 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  33.66 
 
 		 457 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  33.41 
 
 		 457 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  32.3 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 		 442 aa  232  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  33.94 
 
 		 440 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  33.72 
 
 		 441 aa  231  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  34.19 
 
 		 443 aa  226  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  31.62 
 
 		 526 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  34.38 
 
 		 443 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  34.13 
 
 		 443 aa  223  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  32.87 
 
 		 876 aa  223  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  33.98 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  33.98 
 
 		 443 aa  221  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  33.49 
 
 		 443 aa  220  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  33.98 
 
 		 443 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  30.79 
 
 		 528 aa  219  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.345763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>