More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0282 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  85.22 
 
 		 506 aa  807    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  100 
 
 		 504 aa  1040    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  65.49 
 
 		 477 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  69.09 
 
 		 494 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  68.39 
 
 		 501 aa  624  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  57.24 
 
 		 455 aa  527  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  54.78 
 
 		 454 aa  509  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  56.49 
 
 		 465 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  55.24 
 
 		 452 aa  492  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  56.09 
 
 		 470 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  54.23 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  52.07 
 
 		 453 aa  468  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  47.91 
 
 		 484 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  49.78 
 
 		 499 aa  435  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  51.73 
 
 		 479 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  50.7 
 
 		 459 aa  425  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  49.54 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  46.3 
 
 		 441 aa  425  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  46.06 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  48.83 
 
 		 484 aa  418  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  48.83 
 
 		 484 aa  419  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  46.56 
 
 		 459 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  47.65 
 
 		 481 aa  413  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  50 
 
 		 509 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  45.25 
 
 		 442 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  45.02 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  46.61 
 
 		 492 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  51.91 
 
 		 473 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  44.6 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  45.32 
 
 		 448 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  43.27 
 
 		 465 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  43.27 
 
 		 465 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  43.78 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  42.45 
 
 		 450 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  43.03 
 
 		 451 aa  350  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  42.21 
 
 		 451 aa  350  4e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  42.21 
 
 		 450 aa  349  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  42.21 
 
 		 451 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  42.21 
 
 		 451 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  41.73 
 
 		 451 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  42.29 
 
 		 455 aa  339  8e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  43.72 
 
 		 460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  39.34 
 
 		 493 aa  326  5e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  39.32 
 
 		 489 aa  324  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  41.65 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  39.72 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  34.52 
 
 		 530 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  39.49 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  34.55 
 
 		 513 aa  286  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  39.23 
 
 		 461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  37.84 
 
 		 463 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  36.3 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  35.22 
 
 		 514 aa  278  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  38.98 
 
 		 476 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  37.82 
 
 		 459 aa  274  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  36.15 
 
 		 467 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  38.02 
 
 		 477 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  38.14 
 
 		 464 aa  272  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  37.47 
 
 		 464 aa  271  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  35.38 
 
 		 469 aa  269  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  37.99 
 
 		 448 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  37.99 
 
 		 448 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  36.97 
 
 		 460 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  36.97 
 
 		 460 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  36.98 
 
 		 468 aa  266  7e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  37.65 
 
 		 461 aa  266  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  37.62 
 
 		 472 aa  266  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  34.86 
 
 		 457 aa  264  3e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  36.73 
 
 		 460 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  37.62 
 
 		 459 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  36.8 
 
 		 489 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  37.47 
 
 		 428 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  35.6 
 
 		 459 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  36.98 
 
 		 457 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  38.02 
 
 		 448 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  35.35 
 
 		 454 aa  257  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  35.02 
 
 		 456 aa  253  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  35.35 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  35.35 
 
 		 441 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  35.76 
 
 		 463 aa  252  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  34.75 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  36.47 
 
 		 453 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  31.18 
 
 		 528 aa  239  5.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  31.77 
 
 		 532 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  34.83 
 
 		 441 aa  236  7e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  35.45 
 
 		 876 aa  236  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  31.56 
 
 		 526 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  35.43 
 
 		 439 aa  233  6e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  34.43 
 
 		 443 aa  233  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 		 442 aa  232  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  34.2 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2745  peptidase M16 domain protein  31.13 
 
 		 520 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  34.43 
 
 		 443 aa  231  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  34.2 
 
 		 443 aa  231  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  33.49 
 
 		 443 aa  231  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  33.96 
 
 		 443 aa  230  5e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  34.39 
 
 		 443 aa  230  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  34.2 
 
 		 443 aa  230  5e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  33.98 
 
 		 431 aa  229  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  30.15 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>