More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2972 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  100 
 
 		 459 aa  926    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  54.35 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  52.61 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  50.84 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  48.95 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  48.93 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  50.34 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  50.34 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  47.72 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  50.46 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  45.35 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  46.1 
 
 		 514 aa  388  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  48.7 
 
 		 463 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  47.27 
 
 		 477 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  47.39 
 
 		 489 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  46.89 
 
 		 464 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  46.65 
 
 		 464 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  46.81 
 
 		 454 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  47.78 
 
 		 459 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  47.65 
 
 		 459 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  47.95 
 
 		 468 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  46.73 
 
 		 469 aa  363  3e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  47.22 
 
 		 460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  47.22 
 
 		 460 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  47.26 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  46.3 
 
 		 460 aa  353  4e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  43.43 
 
 		 453 aa  349  6e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  45.82 
 
 		 453 aa  343  4e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  41.94 
 
 		 467 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  42.14 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  43.65 
 
 		 453 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  39.43 
 
 		 470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  40.32 
 
 		 452 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  42.79 
 
 		 470 aa  293  5e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  38.43 
 
 		 465 aa  292  8e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  39.95 
 
 		 451 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  38.98 
 
 		 451 aa  275  9e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  41.65 
 
 		 459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  36.94 
 
 		 453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  38.11 
 
 		 450 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  37.82 
 
 		 504 aa  274  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  40.04 
 
 		 466 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  38.12 
 
 		 494 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  36.42 
 
 		 453 aa  273  6e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  37.89 
 
 		 450 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  36.8 
 
 		 441 aa  272  1e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  36.8 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  38.77 
 
 		 451 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  38.42 
 
 		 465 aa  266  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  38.42 
 
 		 465 aa  266  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  37.94 
 
 		 493 aa  265  8.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  36.94 
 
 		 477 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  37.38 
 
 		 506 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  38.76 
 
 		 501 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  38.06 
 
 		 451 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  38.06 
 
 		 451 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  35.08 
 
 		 454 aa  261  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  35.24 
 
 		 493 aa  258  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  37.62 
 
 		 448 aa  256  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  38.04 
 
 		 499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  37.67 
 
 		 492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  34.87 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  38.52 
 
 		 484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  38.28 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  38.98 
 
 		 479 aa  250  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  34.52 
 
 		 489 aa  249  5e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  34.38 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  34.11 
 
 		 459 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  39.37 
 
 		 509 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  35.28 
 
 		 442 aa  247  3e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  39.9 
 
 		 443 aa  246  8e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  36.52 
 
 		 484 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0761  insulinase family protease  33.25 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.126087  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0849  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  32.93 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.745956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  36.9 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  37.95 
 
 		 462 aa  240  4e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1057  M16 family peptidase  33.49 
 
 		 439 aa  239  5.999999999999999e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  31.25 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  31.93 
 
 		 530 aa  232  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  37.3 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  38.43 
 
 		 481 aa  228  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  31.41 
 
 		 440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  34.15 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  34.32 
 
 		 422 aa  212  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  36.22 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  35.95 
 
 		 457 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  35.08 
 
 		 457 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  33.79 
 
 		 424 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  32.64 
 
 		 876 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  29.61 
 
 		 461 aa  207  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  29.41 
 
 		 443 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  28.6 
 
 		 442 aa  206  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  29 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0914  M16 family peptidase  32.05 
 
 		 437 aa  203  4e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000029029  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  29.93 
 
 		 441 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  28.83 
 
 		 440 aa  200  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  34.66 
 
 		 458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  35.28 
 
 		 458 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  29.55 
 
 		 443 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  29.55 
 
 		 443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>