More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3581 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  84.42 
 
 		 443 aa  798    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  81.04 
 
 		 443 aa  759    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  80.81 
 
 		 443 aa  756    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  82.17 
 
 		 443 aa  773    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  81.59 
 
 		 443 aa  759    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  90.31 
 
 		 443 aa  808    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  80.36 
 
 		 443 aa  751    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  82.69 
 
 		 441 aa  767    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  80.81 
 
 		 443 aa  757    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  87.58 
 
 		 443 aa  824    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  82.84 
 
 		 443 aa  773    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  83.07 
 
 		 443 aa  775    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  80.81 
 
 		 442 aa  761    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  80.14 
 
 		 443 aa  756    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  82.62 
 
 		 443 aa  770    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 461 aa  963    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  60.41 
 
 		 447 aa  541  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  60.23 
 
 		 440 aa  507  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  39.71 
 
 		 457 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  39.51 
 
 		 428 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  38.97 
 
 		 457 aa  299  8e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  38.97 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  35.61 
 
 		 876 aa  257  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  34.31 
 
 		 443 aa  256  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  33.25 
 
 		 493 aa  250  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  35.93 
 
 		 431 aa  249  9e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  36.28 
 
 		 470 aa  248  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  32.74 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  36.79 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  33.41 
 
 		 453 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  34.52 
 
 		 422 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  35.48 
 
 		 413 aa  239  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  36.45 
 
 		 439 aa  237  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  35.21 
 
 		 477 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  36.23 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  34.52 
 
 		 494 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  37.02 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  34.2 
 
 		 504 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  33.49 
 
 		 470 aa  230  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  33.33 
 
 		 465 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  33.33 
 
 		 465 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  33.96 
 
 		 501 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  33.79 
 
 		 484 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2753  peptidase M16 domain protein  32.61 
 
 		 532 aa  227  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.346086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  33.73 
 
 		 414 aa  227  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  34.62 
 
 		 441 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  34.63 
 
 		 492 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  35.49 
 
 		 466 aa  226  7e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  30.7 
 
 		 440 aa  226  7e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  33.49 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  34.38 
 
 		 441 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  33.41 
 
 		 514 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  36.23 
 
 		 462 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  33.09 
 
 		 513 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  34.57 
 
 		 411 aa  224  3e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  32.63 
 
 		 440 aa  223  4e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  32.69 
 
 		 506 aa  223  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  32.04 
 
 		 528 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  33.65 
 
 		 921 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1981  M16 family peptidase  31.36 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  32.13 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  32.47 
 
 		 518 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0927  M16 family peptidase  32.13 
 
 		 468 aa  220  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  33.17 
 
 		 465 aa  220  5e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  33.74 
 
 		 482 aa  219  6e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  31.75 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  33.25 
 
 		 458 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0739  processing peptidase  32.48 
 
 		 539 aa  218  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2951  peptidase M16 domain protein  34.07 
 
 		 413 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  33.25 
 
 		 458 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  33.25 
 
 		 458 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  35.12 
 
 		 479 aa  216  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  32.94 
 
 		 463 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  32.35 
 
 		 453 aa  216  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0704  peptidase M16 domain protein  34.91 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  34.15 
 
 		 954 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  31.88 
 
 		 896 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  32.44 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  32.74 
 
 		 453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  35.97 
 
 		 459 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1139  M16 family peptidase  32.98 
 
 		 413 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0687  peptidase M16 domain protein  30.49 
 
 		 494 aa  212  9e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00118117  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  34.05 
 
 		 484 aa  212  9e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  33.66 
 
 		 448 aa  212  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  34.05 
 
 		 484 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  35.29 
 
 		 464 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  30.4 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  30.58 
 
 		 947 aa  211  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  31 
 
 		 459 aa  210  4e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  29.58 
 
 		 467 aa  209  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  31.04 
 
 		 455 aa  209  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  32.63 
 
 		 442 aa  209  9e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  30.51 
 
 		 453 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3357  processing peptidase  30.97 
 
 		 526 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  32.14 
 
 		 476 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  33.41 
 
 		 943 aa  208  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0699  peptidase M16 domain protein  29.88 
 
 		 494 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000162318 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  29.61 
 
 		 459 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  29.9 
 
 		 947 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  31.67 
 
 		 461 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>