More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0063 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  100 
 
 		 459 aa  930    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  58.09 
 
 		 459 aa  531  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  57.98 
 
 		 470 aa  528  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  58.24 
 
 		 466 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  56.95 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  52.53 
 
 		 441 aa  458  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  52.29 
 
 		 441 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  52.83 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  50.78 
 
 		 453 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  47.43 
 
 		 459 aa  445  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  48.49 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  50.47 
 
 		 506 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  50.7 
 
 		 504 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  52.46 
 
 		 448 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  50.24 
 
 		 501 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  49.88 
 
 		 494 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  50.69 
 
 		 452 aa  424  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  49.65 
 
 		 477 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  45.7 
 
 		 454 aa  422  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  46.03 
 
 		 455 aa  418  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  50.11 
 
 		 470 aa  415  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  50.34 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  48.39 
 
 		 451 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  50.11 
 
 		 460 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  48.28 
 
 		 450 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  48.51 
 
 		 450 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  48.56 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  49.06 
 
 		 451 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  48.56 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  48.83 
 
 		 451 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  49.77 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  48.59 
 
 		 451 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  48.36 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  46.63 
 
 		 493 aa  381  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  45.69 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  49.52 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  44.87 
 
 		 484 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  44.12 
 
 		 499 aa  352  8.999999999999999e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  46.24 
 
 		 492 aa  351  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  47.47 
 
 		 509 aa  348  1e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  45.31 
 
 		 484 aa  346  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  44.42 
 
 		 484 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  41.81 
 
 		 530 aa  336  5.999999999999999e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  42.66 
 
 		 493 aa  336  5.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  47.37 
 
 		 473 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  45.84 
 
 		 479 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  43.57 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  40.09 
 
 		 453 aa  320  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  42.27 
 
 		 481 aa  306  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  42.23 
 
 		 463 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  41.22 
 
 		 457 aa  290  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  37.84 
 
 		 514 aa  290  4e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  40.78 
 
 		 461 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  40.62 
 
 		 464 aa  289  8e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  41.46 
 
 		 459 aa  289  9e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  40.77 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  41.06 
 
 		 476 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  37.24 
 
 		 513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  38.41 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  40.1 
 
 		 489 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  40.2 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  41.97 
 
 		 448 aa  279  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  41.97 
 
 		 448 aa  279  9e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  39.95 
 
 		 448 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  40.14 
 
 		 472 aa  276  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  40 
 
 		 477 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  40.39 
 
 		 459 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  40.62 
 
 		 468 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  38.57 
 
 		 876 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  39.02 
 
 		 460 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  39.23 
 
 		 469 aa  264  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  39.32 
 
 		 454 aa  264  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  39.02 
 
 		 460 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  38.19 
 
 		 428 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  39.71 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  38.69 
 
 		 459 aa  260  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  36.69 
 
 		 457 aa  256  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  35.29 
 
 		 447 aa  255  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  36.69 
 
 		 441 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  38.41 
 
 		 463 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  36.45 
 
 		 457 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  35.63 
 
 		 447 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  37.23 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  38.17 
 
 		 453 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  35.9 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  36.71 
 
 		 467 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  36.34 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  36.5 
 
 		 433 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  37.88 
 
 		 422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  35.86 
 
 		 443 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  37.74 
 
 		 424 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  35.63 
 
 		 443 aa  231  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  35.54 
 
 		 441 aa  232  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  34.64 
 
 		 896 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2703  peptidase M16 domain protein  34.75 
 
 		 440 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  35.97 
 
 		 461 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  37.11 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  34.69 
 
 		 442 aa  224  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  35.35 
 
 		 443 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  35.63 
 
 		 443 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>