More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4988 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  97 
 
 
433 aa  860    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  74.36 
 
 
433 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
433 aa  884    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  43.27 
 
 
447 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  41.41 
 
 
448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  39.76 
 
 
451 aa  299  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  39.43 
 
 
451 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  40.15 
 
 
465 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  40.15 
 
 
465 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  38.68 
 
 
450 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  41.09 
 
 
455 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  38.92 
 
 
450 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  38.72 
 
 
451 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  38.24 
 
 
451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  38.48 
 
 
451 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  35.39 
 
 
493 aa  265  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  35.22 
 
 
489 aa  256  4e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  35.75 
 
 
466 aa  253  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  34.79 
 
 
470 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  34.64 
 
 
441 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  34.64 
 
 
441 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  37.23 
 
 
459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  33.89 
 
 
453 aa  240  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  33.92 
 
 
453 aa  239  9e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  33.17 
 
 
470 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  32.26 
 
 
455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  31.49 
 
 
530 aa  233  3e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  32.01 
 
 
454 aa  230  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  35.78 
 
 
453 aa  227  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.92 
 
 
452 aa  224  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  32.43 
 
 
459 aa  224  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  32.11 
 
 
442 aa  219  6e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  30.92 
 
 
506 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  31.86 
 
 
459 aa  217  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  33.01 
 
 
465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  32.93 
 
 
467 aa  216  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  34.24 
 
 
462 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  31.27 
 
 
504 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  32.78 
 
 
460 aa  209  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  33.1 
 
 
461 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  31.75 
 
 
499 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  34.52 
 
 
463 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0094  peptidase M16-like  32.42 
 
 
477 aa  207  3e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  31.13 
 
 
501 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  33.98 
 
 
489 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  32.85 
 
 
476 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1097  putative zinc protease  31.01 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414004  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  33.89 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  29.78 
 
 
494 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2760  peptidase M16 domain-containing protein  31.01 
 
 
448 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  29.95 
 
 
477 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  32.08 
 
 
493 aa  199  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2931  peptidase M16 domain-containing protein  31.58 
 
 
448 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00146664  normal  0.111067 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  29.71 
 
 
492 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  30.88 
 
 
479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  32.54 
 
 
469 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  34.37 
 
 
464 aa  196  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  32.28 
 
 
464 aa  196  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  33.66 
 
 
443 aa  194  3e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  31.89 
 
 
459 aa  194  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2715  peptidase M16 domain-containing protein  31.88 
 
 
472 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395042  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  29.03 
 
 
513 aa  189  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  31.3 
 
 
481 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  29.6 
 
 
484 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  31.4 
 
 
456 aa  187  3e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0361  peptidase M16 protein  32.07 
 
 
453 aa  187  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  30.9 
 
 
459 aa  187  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  30.41 
 
 
459 aa  186  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  28.12 
 
 
514 aa  184  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  30.41 
 
 
454 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  31.99 
 
 
457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  28.92 
 
 
484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  30.41 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  30.41 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1009  peptidase M16 domain-containing protein  30.54 
 
 
468 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1671  peptidase M16-like  32.6 
 
 
509 aa  179  8e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  30.05 
 
 
473 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  28.68 
 
 
484 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  30.19 
 
 
460 aa  176  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4045  peptidase M16-like  30.07 
 
 
463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  30.36 
 
 
469 aa  172  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  30.05 
 
 
443 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  29.78 
 
 
443 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  30.81 
 
 
443 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  28.82 
 
 
447 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  30.05 
 
 
443 aa  170  4e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  29.78 
 
 
443 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  29.92 
 
 
443 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  29.78 
 
 
443 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  29.78 
 
 
443 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  29.78 
 
 
443 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  29.44 
 
 
443 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  30.32 
 
 
959 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  28.84 
 
 
443 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  28.47 
 
 
443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  28.88 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  29.23 
 
 
443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  27.97 
 
 
461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  28.73 
 
 
443 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  32.71 
 
 
458 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>