More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0350 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0350  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
447 aa  905    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5165  peptidase M16 domain-containing protein  44.2 
 
 
433 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.491422  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5115  peptidase M16 domain protein  43.51 
 
 
433 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0363191  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4988  peptidase M16 domain-containing protein  43.27 
 
 
433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03530  peptidase M16-like protein  40.53 
 
 
448 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00356454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4752  insulinase-like:peptidase M16, C-terminal  39.3 
 
 
450 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0494338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0426  peptidase, M16 family  39.07 
 
 
450 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5338  peptidase M16-like  38.6 
 
 
451 aa  295  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4176  peptidase M16 domain-containing protein  40.09 
 
 
455 aa  294  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0478283  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0353  peptidase M16 domain-containing protein  39.43 
 
 
451 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  39.9 
 
 
465 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5162  peptidase M16 domain-containing protein  38.53 
 
 
451 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  39.9 
 
 
465 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4985  peptidase M16 domain-containing protein  38.06 
 
 
451 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5112  peptidase M16 domain protein  38.06 
 
 
451 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.233553  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1941  peptidase M16-like  34.13 
 
 
453 aa  247  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0932  insulinase-like peptidase  34.29 
 
 
489 aa  245  9e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1482  peptidase M16-like  34.05 
 
 
493 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.830241  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0063  M16 family peptidase  35.42 
 
 
459 aa  244  3e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0261125  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  35.39 
 
 
466 aa  244  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2306  peptidase M16 domain-containing protein  37.56 
 
 
443 aa  238  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1927  peptidase M16 domain-containing protein  33.64 
 
 
455 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.464341  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  31.82 
 
 
441 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  31.82 
 
 
441 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  33.33 
 
 
530 aa  236  7e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1632  peptidase M16 domain protein  32.63 
 
 
454 aa  229  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.48477  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  31 
 
 
506 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  32.22 
 
 
459 aa  219  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2107  M16 family peptidase  31.9 
 
 
442 aa  216  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  31.91 
 
 
504 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  34.04 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0217  peptidase, M16 family  31.67 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.233228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  30.75 
 
 
470 aa  212  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  33.26 
 
 
465 aa  211  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3617  peptidase M16 domain protein  31.78 
 
 
470 aa  205  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.903787  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2658  peptidase M16 domain-containing protein  34.19 
 
 
460 aa  199  6e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.287658  hitchhiker  0.000609596 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  31.21 
 
 
453 aa  196  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  27.63 
 
 
494 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0171  peptidase M16 domain protein  30.79 
 
 
462 aa  190  5e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0696206  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  26.88 
 
 
477 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3719  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.83 
 
 
452 aa  189  7e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0647985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  29.45 
 
 
464 aa  189  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0387  putative zinc protease protein  27.63 
 
 
501 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  30.22 
 
 
464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  30.57 
 
 
476 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  30.57 
 
 
469 aa  182  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  29.51 
 
 
513 aa  182  9.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  29.79 
 
 
492 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0892  peptidase M16 domain-containing protein  29.98 
 
 
499 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12862  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0290  peptidase M16 domain-containing protein  30.5 
 
 
456 aa  180  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  29.38 
 
 
461 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  28.67 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  28.47 
 
 
514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0394  peptidase M16 domain protein  30.99 
 
 
459 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0405646  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  34.46 
 
 
949 aa  173  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0019  peptidase M16 domain protein  28.23 
 
 
413 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  28.12 
 
 
493 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2217  peptidase M16 domain-containing protein  29.72 
 
 
454 aa  167  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.800004  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  28.67 
 
 
463 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  28.43 
 
 
489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3872  peptidase M16 domain-containing protein  29.04 
 
 
484 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.817075  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4178  peptidase M16 domain-containing protein  29.26 
 
 
459 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0276  hypothetical protein  27.87 
 
 
411 aa  160  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.166911 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2972  peptidase M16-like  27.46 
 
 
459 aa  160  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7810  putative zinc protease  29.14 
 
 
467 aa  160  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.129356  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1589  peptidase M16 domain protein  27.86 
 
 
414 aa  159  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.43128  normal  0.157627 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3182  zinc protease  26.88 
 
 
411 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1279  peptidase M16-like  30.21 
 
 
481 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2283  peptidase M16 domain protein  29.7 
 
 
460 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366903  normal  0.739928 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3519  peptidase M16 domain-containing protein  27.58 
 
 
484 aa  156  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  25.75 
 
 
440 aa  155  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  29.9 
 
 
479 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1801  peptidase M16 domain-containing protein  28.17 
 
 
469 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  28.84 
 
 
429 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  34.48 
 
 
470 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  27.7 
 
 
443 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4373  peptidase M16 domain protein  30.9 
 
 
473 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  27.64 
 
 
929 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  30.27 
 
 
962 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2842  peptidase M16 domain protein  27.1 
 
 
484 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853184  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2328  peptidase M16 domain-containing protein  30 
 
 
460 aa  150  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.977171  normal  0.638567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  31.21 
 
 
876 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2605  peptidase M16 domain protein  30 
 
 
460 aa  150  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.204595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  27.46 
 
 
443 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  31.04 
 
 
422 aa  149  7e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2274  peptidase M16 domain-containing protein  31.47 
 
 
424 aa  149  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0845723  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  30.27 
 
 
960 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  27.23 
 
 
443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2863  peptidase M16 domain protein  26.84 
 
 
457 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  30.16 
 
 
429 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  29.95 
 
 
943 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1057  M16 family peptidase  26.79 
 
 
439 aa  146  6e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  27.87 
 
 
443 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  28.61 
 
 
482 aa  146  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  27 
 
 
443 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  24.88 
 
 
440 aa  146  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  26.7 
 
 
443 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  34.24 
 
 
458 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  27.1 
 
 
443 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  27.42 
 
 
442 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>